133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3801 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3801  peptidase S41  100 
 
 		 747 aa  1517    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0586877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1277  peptidase S41  33.08 
 
 		 547 aa  278  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2226  peptidase S41  22.02 
 
 		 455 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  22.95 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  23.26 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 299 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 		 400 aa  63.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  23.78 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  23.35 
 
 		 1193 aa  62.4  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 299 aa  62  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 299 aa  62  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 299 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 299 aa  62  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 299 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 299 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2244  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.26 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  22.4 
 
 		 1104 aa  57.4  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  22.19 
 
 		 1097 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  23.66 
 
 		 1094 aa  56.2  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  29.28 
 
 		 444 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  24.35 
 
 		 410 aa  55.8  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  25.85 
 
 		 433 aa  55.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  23.08 
 
 		 475 aa  55.5  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  22.82 
 
 		 432 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  25.56 
 
 		 377 aa  54.7  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1994  C-terminal processing peptidase  27 
 
 		 404 aa  54.3  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.72907  normal  0.0163388 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  29.28 
 
 		 444 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  22.59 
 
 		 1167 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  28.18 
 
 		 444 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  23.56 
 
 		 1094 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  23.79 
 
 		 436 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  23.41 
 
 		 1084 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  23.21 
 
 		 1094 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  21.8 
 
 		 1082 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  23.21 
 
 		 1094 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  27 
 
 		 449 aa  52.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  23.21 
 
 		 1094 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  22.31 
 
 		 457 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  22 
 
 		 1092 aa  52.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0309  carboxyl-terminal protease  27.08 
 
 		 737 aa  51.6  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0982282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  23.06 
 
 		 1093 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  23.06 
 
 		 1093 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  24.09 
 
 		 444 aa  51.6  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  23.06 
 
 		 1093 aa  51.2  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0315  carboxyl-terminal protease  25.19 
 
 		 735 aa  51.2  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144056  hitchhiker  0.0000288236 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  30.43 
 
 		 438 aa  50.8  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  24.25 
 
 		 429 aa  50.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2272  peptidase S41  30.51 
 
 		 400 aa  50.8  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  25.63 
 
 		 377 aa  50.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  23.1 
 
 		 457 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  29.83 
 
 		 401 aa  50.8  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  23.13 
 
 		 445 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1209  peptidase S41  31.62 
 
 		 422 aa  50.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000636879  normal  0.518205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  23.27 
 
 		 401 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  22.49 
 
 		 1094 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  20.51 
 
 		 1090 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1268  carboxyl-terminal protease  28.1 
 
 		 693 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000748265  normal  0.0247488 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  23.5 
 
 		 1094 aa  49.3  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  23.57 
 
 		 431 aa  49.3  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05520  C-terminal processing peptidase  28.8 
 
 		 424 aa  48.9  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  22.94 
 
 		 1094 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  21.65 
 
 		 1079 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  23.62 
 
 		 418 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  27.27 
 
 		 445 aa  48.9  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  27.27 
 
 		 445 aa  48.9  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  23.78 
 
 		 455 aa  48.5  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0725  tail specific protease precursor, putative  24.83 
 
 		 649 aa  48.1  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4000  carboxyl-terminal protease  27.62 
 
 		 704 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00109251  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1719  carboxyl-terminal protease  27.62 
 
 		 704 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0889073  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  25.95 
 
 		 479 aa  48.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 432 aa  48.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1311  carboxyl-terminal protease  27.62 
 
 		 693 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299557 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0282  C-terminal processing peptidase-1  25.52 
 
 		 737 aa  47.8  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 		 451 aa  47.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 438 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 438 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  26.4 
 
 		 418 aa  47.8  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 377 aa  47.4  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  27.07 
 
 		 444 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  26.49 
 
 		 451 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  25.38 
 
 		 441 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  25.42 
 
 		 439 aa  47  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  24.26 
 
 		 428 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  22.61 
 
 		 389 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1544  carboxy-terminal protease  24.48 
 
 		 672 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  26.7 
 
 		 443 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 438 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 		 463 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  23.88 
 
 		 482 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  26.94 
 
 		 440 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  28.42 
 
 		 498 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1679  C-terminal processing peptidase-1  26.92 
 
 		 705 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  22.25 
 
 		 451 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  24.26 
 
 		 428 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  38.61 
 
 		 721 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  20.14 
 
 		 421 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  26.42 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  28.87 
 
 		 423 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  25.34 
 
 		 478 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  26.42 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>