273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3315 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  73.72 
 
 		 1092 aa  1702    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  70.48 
 
 		 1094 aa  1610    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  79.8 
 
 		 1094 aa  1823    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  71.66 
 
 		 1094 aa  1623    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  71.3 
 
 		 1094 aa  1619    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  100 
 
 		 1097 aa  2249    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  71.57 
 
 		 1094 aa  1625    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  71.48 
 
 		 1094 aa  1622    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  71.96 
 
 		 1094 aa  1644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  71.48 
 
 		 1093 aa  1623    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  71.39 
 
 		 1093 aa  1623    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  67.55 
 
 		 1094 aa  1528    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  71.39 
 
 		 1093 aa  1623    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  64.11 
 
 		 1084 aa  1451    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  72.19 
 
 		 1104 aa  1658    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  29.55 
 
 		 1079 aa  433  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  29.95 
 
 		 1167 aa  432  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  28.85 
 
 		 1117 aa  415  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  29.11 
 
 		 1104 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  29.15 
 
 		 1089 aa  402  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  27.38 
 
 		 1075 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  29 
 
 		 1059 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  28.56 
 
 		 1016 aa  370  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  27.69 
 
 		 1065 aa  369  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  26.73 
 
 		 1069 aa  331  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1051 aa  312  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  25.88 
 
 		 1147 aa  310  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  32.37 
 
 		 1181 aa  307  7e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  30.85 
 
 		 1183 aa  306  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  27.65 
 
 		 1008 aa  291  6e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  26.49 
 
 		 1107 aa  287  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  26.12 
 
 		 1186 aa  276  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.82 
 
 		 1067 aa  257  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  37.27 
 
 		 1545 aa  246  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  36.91 
 
 		 1545 aa  245  3e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.86 
 
 		 1082 aa  244  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24.54 
 
 		 1090 aa  234  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  23.87 
 
 		 1097 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  24.84 
 
 		 1125 aa  204  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  23.75 
 
 		 1084 aa  182  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  21.62 
 
 		 1076 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  39.91 
 
 		 1484 aa  155  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  24.42 
 
 		 1193 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  23.05 
 
 		 1354 aa  127  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  26.21 
 
 		 483 aa  94.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  25.74 
 
 		 425 aa  94  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  26.28 
 
 		 482 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  25.52 
 
 		 428 aa  91.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  24.53 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  23.98 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  25.49 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  22.37 
 
 		 1138 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  24.2 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  22.2 
 
 		 1071 aa  65.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  23.56 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  31.29 
 
 		 440 aa  63.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  23.59 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  24.28 
 
 		 427 aa  62  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  31.9 
 
 		 441 aa  62  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  21.41 
 
 		 1069 aa  61.6  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  21.66 
 
 		 1081 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  19.65 
 
 		 1059 aa  60.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  24.58 
 
 		 428 aa  60.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  22.25 
 
 		 472 aa  60.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  24.5 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  24.26 
 
 		 377 aa  60.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  26.48 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  33.12 
 
 		 1062 aa  59.3  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  23.06 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  23.68 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  22.66 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  25.14 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  21.24 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  21.24 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  23.32 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  23.91 
 
 		 428 aa  57.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  22.16 
 
 		 1066 aa  57.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.73 
 
 		 397 aa  56.6  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3801  peptidase S41  22.19 
 
 		 747 aa  57  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0586877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  32.98 
 
 		 416 aa  57.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.85 
 
 		 497 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  22.95 
 
 		 418 aa  55.8  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  22.16 
 
 		 1062 aa  55.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  28.21 
 
 		 489 aa  55.5  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  21.59 
 
 		 430 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  27.05 
 
 		 420 aa  55.1  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.42 
 
 		 446 aa  55.1  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  21.59 
 
 		 430 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  24.49 
 
 		 1010 aa  54.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  30.46 
 
 		 440 aa  54.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  21.72 
 
 		 590 aa  53.9  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  23.16 
 
 		 379 aa  54.3  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  21.68 
 
 		 1062 aa  54.3  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  24.31 
 
 		 423 aa  53.5  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.1 
 
 		 1028 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  23.12 
 
 		 428 aa  53.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  22.69 
 
 		 1031 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.67 
 
 		 445 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>