More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0038 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0038  C-terminal processing peptidase  100 
 
 
534 aa  1053    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1647  peptidase S41  46.53 
 
 
596 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.754893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3204  C-terminal processing peptidase  35.13 
 
 
566 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  33.9 
 
 
446 aa  172  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  34.11 
 
 
457 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  30.16 
 
 
440 aa  169  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  30.82 
 
 
438 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  33.98 
 
 
482 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  33.98 
 
 
482 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  32.44 
 
 
442 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  31.1 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 
459 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  31.1 
 
 
424 aa  167  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  32.9 
 
 
445 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  32.36 
 
 
445 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  28.54 
 
 
439 aa  166  9e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  32.44 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  36.19 
 
 
437 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  30.94 
 
 
468 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  35.87 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  33.67 
 
 
426 aa  163  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  32.11 
 
 
439 aa  163  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  35.56 
 
 
437 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  33.1 
 
 
436 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  30.77 
 
 
440 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  31.44 
 
 
438 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  33.1 
 
 
436 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  30.77 
 
 
440 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  30.72 
 
 
463 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  32.36 
 
 
440 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  31.96 
 
 
445 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  33.67 
 
 
439 aa  160  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  31.21 
 
 
455 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  31.96 
 
 
445 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  30.91 
 
 
443 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  31.44 
 
 
440 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  28.48 
 
 
471 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  29.77 
 
 
444 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  32.07 
 
 
439 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  31.39 
 
 
440 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  31.05 
 
 
449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  31.61 
 
 
446 aa  157  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  31.13 
 
 
566 aa  157  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  31.54 
 
 
423 aa  156  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  31.38 
 
 
438 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  30.89 
 
 
423 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  32.42 
 
 
432 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  32.99 
 
 
398 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  31.01 
 
 
453 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  31.83 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  30.89 
 
 
451 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  31.16 
 
 
435 aa  154  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  31.29 
 
 
439 aa  154  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  27.81 
 
 
452 aa  153  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  30.67 
 
 
437 aa  153  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  31.09 
 
 
451 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  30.42 
 
 
444 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  30.69 
 
 
438 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  30.69 
 
 
438 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  30 
 
 
441 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  29.97 
 
 
440 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  30.34 
 
 
437 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  29.84 
 
 
457 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  30.12 
 
 
444 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  36.3 
 
 
507 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  32.41 
 
 
428 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  28.44 
 
 
444 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  29.64 
 
 
440 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  29.64 
 
 
440 aa  150  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  29.52 
 
 
458 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  30.06 
 
 
447 aa  150  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  30.82 
 
 
434 aa  150  8e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  33.11 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  29.65 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  28.14 
 
 
439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  32.54 
 
 
569 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  33.11 
 
 
458 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  31.51 
 
 
415 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  29.21 
 
 
443 aa  148  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  34.98 
 
 
498 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  28.97 
 
 
418 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 
456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  28.62 
 
 
410 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  30.95 
 
 
401 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  30.32 
 
 
572 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  28.53 
 
 
444 aa  146  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  30.19 
 
 
450 aa  146  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  31.67 
 
 
401 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  30.36 
 
 
443 aa  146  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  28.67 
 
 
434 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  32.58 
 
 
434 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  32.09 
 
 
441 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  28.66 
 
 
445 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  28.94 
 
 
448 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  28.94 
 
 
448 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  29 
 
 
444 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  29.11 
 
 
461 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  34.14 
 
 
428 aa  144  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  30.1 
 
 
555 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  35.57 
 
 
447 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>