More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3204 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3204  C-terminal processing peptidase  100 
 
 		 566 aa  1126    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1647  peptidase S41  36.48 
 
 		 596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.754893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0038  C-terminal processing peptidase  35.13 
 
 		 534 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  41.2 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  41.2 
 
 		 440 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  42.91 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  40.72 
 
 		 471 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  38.02 
 
 		 424 aa  211  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  41.37 
 
 		 446 aa  211  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  38.02 
 
 		 424 aa  209  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  38.94 
 
 		 458 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  42.53 
 
 		 440 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  40.91 
 
 		 440 aa  209  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  40.91 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  40.53 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  40.92 
 
 		 441 aa  209  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  40.73 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  36.42 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  40.91 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  37.05 
 
 		 442 aa  209  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  41.37 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  40.2 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  35.25 
 
 		 445 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.12 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  40.71 
 
 		 437 aa  206  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  35.74 
 
 		 461 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  39.32 
 
 		 457 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  38.01 
 
 		 456 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  37.42 
 
 		 451 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  39.29 
 
 		 447 aa  203  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  36.15 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 		 449 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  37.38 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  40.26 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  40.79 
 
 		 463 aa  200  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  40.2 
 
 		 444 aa  200  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  35.82 
 
 		 441 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  36.66 
 
 		 443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  33.99 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  37.62 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  37.78 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  39.6 
 
 		 439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  35.8 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  36.44 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  35.79 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  39.33 
 
 		 448 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  38.94 
 
 		 498 aa  196  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  38.2 
 
 		 443 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  39.6 
 
 		 463 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 		 457 aa  196  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  38.77 
 
 		 438 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  38.77 
 
 		 438 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  39.27 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  36.96 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  35.44 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  37.26 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  40.2 
 
 		 507 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  36.2 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  40.07 
 
 		 432 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  38.67 
 
 		 449 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.37 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  40.34 
 
 		 440 aa  189  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  36.93 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  36.63 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  40.21 
 
 		 438 aa  187  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  37.62 
 
 		 436 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  36.63 
 
 		 445 aa  187  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 444 aa  187  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  37.62 
 
 		 436 aa  187  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  35.11 
 
 		 455 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  39.46 
 
 		 462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 401 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  35.92 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  35.92 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  37.01 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  35 
 
 		 401 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  36.3 
 
 		 572 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  33.74 
 
 		 423 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  35.39 
 
 		 401 aa  183  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  36.11 
 
 		 428 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  39.54 
 
 		 446 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  36.81 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  38.23 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  37.59 
 
 		 439 aa  182  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  33.05 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  37.05 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  35.83 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  34.98 
 
 		 435 aa  181  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  35.33 
 
 		 468 aa  181  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  36.45 
 
 		 401 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  36.16 
 
 		 402 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  40.83 
 
 		 484 aa  180  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  33.33 
 
 		 401 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  34.95 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>