19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3865 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3865  peptidase S41  100 
 
 		 763 aa  1474    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0264679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3207  peptidase S41  26.71 
 
 		 692 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000881492  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2935  peptidase S41  26.07 
 
 		 691 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000791887  normal  0.0220512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  25.79 
 
 		 440 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2210  peptidase S41  22.91 
 
 		 558 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185176  normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  29.02 
 
 		 389 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  24.56 
 
 		 458 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  24.56 
 
 		 458 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  22.5 
 
 		 401 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  24.77 
 
 		 582 aa  49.7  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  25.12 
 
 		 446 aa  48.9  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  25.51 
 
 		 401 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  25.39 
 
 		 401 aa  47.8  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  25.39 
 
 		 401 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  24.52 
 
 		 446 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  27.69 
 
 		 461 aa  45.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  26.07 
 
 		 409 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  25.71 
 
 		 428 aa  44.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  25.61 
 
 		 482 aa  43.9  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>