More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0655 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0655  peptidase S41  100 
 
 		 329 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0487993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  49.69 
 
 		 337 aa  301  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1489  peptidase S41  29.29 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  31.67 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00358  peptidase, S41 family  28.16 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0061  peptidase S41  30.74 
 
 		 441 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.830386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  30.11 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  27.97 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8877  peptidase S41  27.61 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6781  peptidase S41  25.43 
 
 		 347 aa  89.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  29.1 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  29.17 
 
 		 429 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  30.32 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  29.96 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  33.15 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  31.4 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  28.28 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  29.17 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  28.16 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  32.77 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  29.17 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  27.65 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1988  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 698 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 678 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1286  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000018564  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1470  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0690257  normal  0.257685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  30.65 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1984  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00711922  hitchhiker  0.00523275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2046  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1672  carboxy-terminal protease  31.71 
 
 		 690 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000704013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  30.11 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  33.33 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1783  carboxy-terminal protease  31.71 
 
 		 692 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00680502  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  28.89 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  30.11 
 
 		 440 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  29.57 
 
 		 444 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2141  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 671 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  31.25 
 
 		 401 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  32.62 
 
 		 401 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 671 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  25.65 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  29.69 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2400  carboxy-terminal protease  31.71 
 
 		 682 aa  66.6  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  36.09 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  36.97 
 
 		 664 aa  66.2  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  29.44 
 
 		 455 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  30.72 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1357  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 680 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000834708  normal  0.174046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  30.23 
 
 		 383 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 		 721 aa  65.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01801  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  32.52 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1812  carboxyl-terminal protease  32.52 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  30.9 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2563  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 680 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000036056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2059  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028938  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5898  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 		 705 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1802  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0594829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2098  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592203  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1921  carboxy-terminal protease  32.52 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  30.43 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01789  hypothetical protein  32.52 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  29.83 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  29.31 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  30.06 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  29.17 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  28.04 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  37.74 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  30.46 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  28.26 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  25.65 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  30.88 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  29.38 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2663  carboxy-terminal protease  31.71 
 
 		 689 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000297932  hitchhiker  0.0063771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1845  carboxy-terminal protease  33.33 
 
 		 673 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  32.65 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  34.53 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  26.94 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  27.66 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  30.56 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  25.13 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  28.9 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  32.09 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  25.85 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  32.43 
 
 		 664 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  31.3 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  28.42 
 
 		 446 aa  62.4  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  28.49 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  29.55 
 
 		 444 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  28.87 
 
 		 441 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  31.21 
 
 		 401 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  25.49 
 
 		 479 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4122  carboxyl-terminal protease  39.13 
 
 		 697 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  32.12 
 
 		 389 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4634  carboxyl-terminal protease  31.76 
 
 		 709 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0425581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  28.87 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003431  tail-specific protease precursor  31.67 
 
 		 668 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00461835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>