70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8877 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8877  peptidase S41  100 
 
 		 301 aa  606  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  39.93 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1489  peptidase S41  40.14 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0061  peptidase S41  36.97 
 
 		 441 aa  142  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.830386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  32.09 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00358  peptidase, S41 family  32.3 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  28.39 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  34.02 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0655  peptidase S41  27.49 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0487993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6781  peptidase S41  30.46 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  30.73 
 
 		 1193 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1994  C-terminal processing peptidase  28.64 
 
 		 404 aa  55.8  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.72907  normal  0.0163388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  26.83 
 
 		 554 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  26.29 
 
 		 415 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1002  peptidase S41  30.46 
 
 		 535 aa  52.8  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  30.86 
 
 		 389 aa  52.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  28.33 
 
 		 407 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  27.75 
 
 		 472 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1110  carboxyl-terminal protease  27.18 
 
 		 535 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00431691  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  24.87 
 
 		 410 aa  49.7  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  28.04 
 
 		 1104 aa  49.3  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  30.17 
 
 		 507 aa  48.9  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  26.9 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  25.64 
 
 		 513 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  25.64 
 
 		 511 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  25.64 
 
 		 515 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  29.05 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  27.32 
 
 		 470 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  27.36 
 
 		 472 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  25.39 
 
 		 522 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  25.39 
 
 		 526 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  26.59 
 
 		 389 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 377 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  27.78 
 
 		 417 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  28.16 
 
 		 413 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  26.26 
 
 		 401 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  27.17 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  24.86 
 
 		 441 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  24.1 
 
 		 515 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  24.62 
 
 		 515 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  24.62 
 
 		 515 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  26.26 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  28.16 
 
 		 1084 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  26.52 
 
 		 434 aa  45.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  27.17 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  24.62 
 
 		 515 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  26.13 
 
 		 477 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1111  carboxyl-terminal protease  29.73 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0155619  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  25.48 
 
 		 477 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  25.63 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  25.38 
 
 		 401 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  27.96 
 
 		 1094 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  26.7 
 
 		 401 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  26.45 
 
 		 535 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  30.69 
 
 		 1093 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  25.91 
 
 		 444 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  30.69 
 
 		 1093 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  30.69 
 
 		 1093 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 453 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  29.35 
 
 		 412 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 		 401 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2248  peptidase S41  26.86 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  26.44 
 
 		 494 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 		 401 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  24.11 
 
 		 400 aa  42.7  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  27.98 
 
 		 429 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  26.92 
 
 		 377 aa  42.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1001  peptidase S41  27.27 
 
 		 533 aa  42.4  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.489176  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 483 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  29.65 
 
 		 428 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>