17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0187 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0187  peptidase S41  100 
 
 
466 aa  954    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0745  peptidase S41  32.72 
 
 
435 aa  181  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0724  hypothetical protein  25.12 
 
 
434 aa  79.7  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.754516  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0715  hypothetical protein  29.31 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000903644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0723  hypothetical protein  24.47 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182776  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0969  hypothetical protein  22.42 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2481  peptidase S41  24.65 
 
 
406 aa  64.3  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2480  peptidase S41  24.86 
 
 
413 aa  63.9  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0722  putative lipoprotein  27.7 
 
 
421 aa  63.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0474346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1354  peptidase S41  20.44 
 
 
367 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405316  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  26.73 
 
 
377 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0951  hypothetical protein  29.92 
 
 
520 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3411  hypothetical protein  29.13 
 
 
518 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  34.52 
 
 
434 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3345  S41 family protease  23.23 
 
 
337 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0959  hypothetical protein  29.13 
 
 
520 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.628982  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0925  hypothetical protein  29.13 
 
 
520 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>