72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0852 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  39.93 
 
 
1176 aa  669    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  100 
 
 
1176 aa  2336    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.29 
 
 
1383 aa  311  6.999999999999999e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.54 
 
 
1292 aa  295  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.42 
 
 
1607 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  54.01 
 
 
633 aa  287  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.26 
 
 
887 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  52.74 
 
 
1848 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  53.63 
 
 
2802 aa  284  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  52.2 
 
 
1026 aa  281  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.86 
 
 
810 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  55.43 
 
 
1285 aa  275  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.17 
 
 
1126 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.09 
 
 
408 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  49.7 
 
 
1178 aa  273  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.85 
 
 
714 aa  271  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.36 
 
 
805 aa  271  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.5 
 
 
1130 aa  271  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.28 
 
 
1507 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.9 
 
 
1221 aa  267  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.68 
 
 
826 aa  266  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  43.52 
 
 
540 aa  258  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  52.54 
 
 
1195 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.54 
 
 
1183 aa  254  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  47.81 
 
 
920 aa  254  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  47.73 
 
 
884 aa  252  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  41.69 
 
 
721 aa  250  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  48.84 
 
 
862 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  43.7 
 
 
1255 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  50.7 
 
 
791 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  45.92 
 
 
701 aa  236  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  45.89 
 
 
462 aa  234  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  36.63 
 
 
640 aa  232  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  53.17 
 
 
933 aa  226  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  40 
 
 
664 aa  225  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  50.8 
 
 
288 aa  225  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  44.36 
 
 
648 aa  204  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  28.82 
 
 
3563 aa  201  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  45.95 
 
 
1083 aa  165  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  29.34 
 
 
1991 aa  135  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  25.82 
 
 
1280 aa  129  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  30.94 
 
 
1027 aa  98.2  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  28.5 
 
 
858 aa  97.8  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.63 
 
 
2807 aa  95.9  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  29.29 
 
 
889 aa  95.1  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  29.46 
 
 
901 aa  94  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  27.7 
 
 
1933 aa  85.9  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  31.68 
 
 
2198 aa  81.6  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  32.97 
 
 
14944 aa  77.4  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  28.39 
 
 
2467 aa  75.5  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  32.38 
 
 
1657 aa  72.8  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  24.68 
 
 
8871 aa  71.6  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  28.44 
 
 
1588 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  26.49 
 
 
1100 aa  68.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  42.27 
 
 
1362 aa  62.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  27.78 
 
 
665 aa  61.6  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  32.74 
 
 
1132 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  30.87 
 
 
972 aa  60.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  24.2 
 
 
1585 aa  60.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  41.38 
 
 
441 aa  59.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  23.18 
 
 
857 aa  55.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  37.82 
 
 
1969 aa  55.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  40.85 
 
 
1550 aa  55.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  25.07 
 
 
864 aa  55.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  32.31 
 
 
523 aa  52.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  39.13 
 
 
2003 aa  50.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  33.33 
 
 
1976 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  29.28 
 
 
2713 aa  47  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  28.4 
 
 
910 aa  46.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4872  hypothetical protein  27.63 
 
 
440 aa  46.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  26.92 
 
 
569 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  27.52 
 
 
429 aa  45.8  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.105703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>