More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4248 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  100 
 
 		 1848 aa  3607    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  62.61 
 
 		 2802 aa  413  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.2 
 
 		 1383 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  57.19 
 
 		 714 aa  350  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.66 
 
 		 1221 aa  346  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  53.07 
 
 		 1026 aa  343  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.61 
 
 		 810 aa  341  9e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.12 
 
 		 826 aa  340  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.13 
 
 		 1507 aa  337  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.97 
 
 		 1126 aa  335  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  52.12 
 
 		 1130 aa  330  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  51.09 
 
 		 920 aa  328  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  46.5 
 
 		 1176 aa  327  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  52.05 
 
 		 1607 aa  324  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.41 
 
 		 805 aa  323  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  41.89 
 
 		 1195 aa  320  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  50.45 
 
 		 1178 aa  318  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  47.58 
 
 		 721 aa  317  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.14 
 
 		 540 aa  315  7.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  50.43 
 
 		 633 aa  314  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  48.89 
 
 		 884 aa  309  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.03 
 
 		 1183 aa  306  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.56 
 
 		 408 aa  306  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  47.83 
 
 		 1255 aa  305  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  50.75 
 
 		 701 aa  305  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  47.26 
 
 		 640 aa  299  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.55 
 
 		 887 aa  293  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  46.25 
 
 		 1292 aa  291  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  52.63 
 
 		 1285 aa  290  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  40.66 
 
 		 862 aa  290  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  49.84 
 
 		 462 aa  285  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  52.4 
 
 		 1176 aa  285  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  49.02 
 
 		 791 aa  283  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.92 
 
 		 664 aa  274  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  50.16 
 
 		 933 aa  273  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  40.81 
 
 		 558 aa  256  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  45.07 
 
 		 553 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  46.05 
 
 		 477 aa  245  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  46.87 
 
 		 569 aa  241  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  49.29 
 
 		 579 aa  241  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.55 
 
 		 555 aa  238  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  40.99 
 
 		 3563 aa  235  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.14 
 
 		 570 aa  234  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  44.11 
 
 		 792 aa  233  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  46.62 
 
 		 648 aa  229  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.24 
 
 		 554 aa  228  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  44.94 
 
 		 560 aa  228  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  43.89 
 
 		 577 aa  228  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.18 
 
 		 561 aa  227  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.75 
 
 		 555 aa  227  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  48.19 
 
 		 288 aa  218  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  43.2 
 
 		 546 aa  218  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  47.96 
 
 		 551 aa  215  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  42.11 
 
 		 776 aa  215  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  42.78 
 
 		 778 aa  212  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  41.87 
 
 		 554 aa  210  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  42.32 
 
 		 566 aa  206  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.29 
 
 		 556 aa  206  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  40.15 
 
 		 784 aa  204  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.85 
 
 		 567 aa  204  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  35.68 
 
 		 743 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  32.92 
 
 		 911 aa  199  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  38.48 
 
 		 737 aa  197  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  40 
 
 		 837 aa  196  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  46.35 
 
 		 558 aa  193  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.69 
 
 		 417 aa  190  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  38.11 
 
 		 593 aa  190  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  43.09 
 
 		 389 aa  189  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  40 
 
 		 563 aa  189  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 2082 aa  188  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.9 
 
 		 821 aa  186  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.69 
 
 		 1679 aa  186  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.9 
 
 		 1919 aa  186  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.63 
 
 		 818 aa  181  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  35.97 
 
 		 714 aa  177  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  38.01 
 
 		 681 aa  174  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  34.25 
 
 		 717 aa  173  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  35.98 
 
 		 835 aa  172  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  33.12 
 
 		 461 aa  171  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  37.28 
 
 		 1129 aa  169  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  40.19 
 
 		 443 aa  169  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  38.6 
 
 		 900 aa  168  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  36.15 
 
 		 726 aa  166  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  38.98 
 
 		 376 aa  166  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  32.69 
 
 		 461 aa  164  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.42 
 
 		 469 aa  164  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  45.41 
 
 		 1083 aa  162  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  31.54 
 
 		 807 aa  153  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.97 
 
 		 706 aa  149  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 449 aa  150  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  32.19 
 
 		 363 aa  149  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  32.19 
 
 		 363 aa  149  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  37.36 
 
 		 624 aa  147  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.48 
 
 		 553 aa  145  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  30.05 
 
 		 341 aa  143  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  34.22 
 
 		 403 aa  141  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  30.66 
 
 		 1187 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  31.76 
 
 		 547 aa  135  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  37.47 
 
 		 1222 aa  133  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  32.27 
 
 		 1207 aa  130  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>