142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1792 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  100 
 
 
417 aa  823    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  44.05 
 
 
778 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  43.34 
 
 
792 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  41.73 
 
 
784 aa  233  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.78 
 
 
454 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  38.36 
 
 
450 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  42.58 
 
 
776 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  40.54 
 
 
389 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.82 
 
 
563 aa  216  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  44.29 
 
 
551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  37.94 
 
 
743 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.25 
 
 
554 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  39.33 
 
 
477 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.33 
 
 
837 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  43.98 
 
 
579 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  41.07 
 
 
2082 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.43 
 
 
561 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.01 
 
 
567 aa  202  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  42.06 
 
 
553 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  42.2 
 
 
558 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.57 
 
 
556 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.43 
 
 
1679 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  42.05 
 
 
569 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.19 
 
 
821 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.11 
 
 
818 aa  193  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  36.21 
 
 
403 aa  192  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  41.93 
 
 
577 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  36.48 
 
 
911 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.23 
 
 
555 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  44.17 
 
 
560 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  41.69 
 
 
1848 aa  190  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  38.29 
 
 
593 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  43.14 
 
 
546 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.84 
 
 
1919 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  37.99 
 
 
1129 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.84 
 
 
570 aa  186  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  39.54 
 
 
376 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  37.72 
 
 
726 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  41.53 
 
 
554 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  34.55 
 
 
461 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  42.25 
 
 
566 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.55 
 
 
555 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  36.36 
 
 
363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  36.36 
 
 
363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.94 
 
 
469 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  39.22 
 
 
443 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  35.36 
 
 
461 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  40.97 
 
 
558 aa  169  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.51 
 
 
553 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  33.33 
 
 
835 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  39.7 
 
 
681 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  39.87 
 
 
717 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  32.61 
 
 
714 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.18 
 
 
706 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  32.62 
 
 
807 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  33 
 
 
449 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.33 
 
 
787 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  34.82 
 
 
737 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 
745 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  31.96 
 
 
1222 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.25 
 
 
817 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  32.49 
 
 
1207 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  32.43 
 
 
547 aa  123  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  33.09 
 
 
558 aa  122  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  34.39 
 
 
624 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.84 
 
 
692 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.28 
 
 
900 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.08 
 
 
941 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  31.22 
 
 
1187 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.41 
 
 
1147 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  27.59 
 
 
341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.17 
 
 
810 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  33.98 
 
 
618 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  31.37 
 
 
638 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.75 
 
 
1126 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  31.83 
 
 
418 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  32.63 
 
 
544 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  29.06 
 
 
597 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  31.75 
 
 
602 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  35.34 
 
 
535 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  37.44 
 
 
375 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  31.52 
 
 
332 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  28.27 
 
 
328 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  30.06 
 
 
643 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  27.79 
 
 
1312 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  30.36 
 
 
533 aa  93.2  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  26.52 
 
 
499 aa  92.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  28.12 
 
 
575 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  26.38 
 
 
727 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  27.44 
 
 
643 aa  90.9  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  28.64 
 
 
454 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  27.95 
 
 
728 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  29.2 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.36 
 
 
921 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.48 
 
 
209 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  25.94 
 
 
399 aa  87.4  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  26.69 
 
 
375 aa  87  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  29.39 
 
 
547 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  51.22 
 
 
106 aa  84  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  28.79 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>