124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0169 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 
1207 aa  2412    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  49.23 
 
 
787 aa  704    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  66.08 
 
 
1187 aa  1539    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  49.48 
 
 
817 aa  717    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  39.9 
 
 
784 aa  405  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  40.4 
 
 
778 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.81 
 
 
837 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  40 
 
 
792 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  38.83 
 
 
776 aa  365  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  44.75 
 
 
941 aa  301  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  41.4 
 
 
535 aa  284  8.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  43.88 
 
 
544 aa  270  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  43.5 
 
 
454 aa  270  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  41.16 
 
 
602 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.23 
 
 
818 aa  251  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  39.76 
 
 
447 aa  239  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  38.69 
 
 
1147 aa  234  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.72 
 
 
821 aa  234  8.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  49.56 
 
 
326 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  29.78 
 
 
2082 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.11 
 
 
553 aa  194  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  26.95 
 
 
743 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  37.66 
 
 
389 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  28.17 
 
 
717 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  27.88 
 
 
911 aa  159  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  31.53 
 
 
551 aa  151  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  28.54 
 
 
714 aa  152  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.09 
 
 
556 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  37.26 
 
 
618 aa  149  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.47 
 
 
554 aa  147  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  32.5 
 
 
477 aa  147  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  35.24 
 
 
376 aa  145  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  32.93 
 
 
593 aa  145  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  32.52 
 
 
579 aa  145  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  34.07 
 
 
569 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.98 
 
 
563 aa  140  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.39 
 
 
561 aa  138  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  30.87 
 
 
577 aa  135  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  30.49 
 
 
560 aa  135  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  25.21 
 
 
14609 aa  134  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  34.85 
 
 
546 aa  134  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  31.94 
 
 
558 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  31.72 
 
 
449 aa  131  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.12 
 
 
555 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.27 
 
 
1848 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.61 
 
 
810 aa  131  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  31.21 
 
 
558 aa  130  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 
555 aa  129  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.7 
 
 
570 aa  128  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  32.91 
 
 
553 aa  128  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.44 
 
 
567 aa  126  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  35.24 
 
 
681 aa  127  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  30.82 
 
 
554 aa  125  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.41 
 
 
417 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  34.21 
 
 
566 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.98 
 
 
1679 aa  122  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.18 
 
 
900 aa  120  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  30.73 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  27.33 
 
 
1222 aa  118  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  28.42 
 
 
403 aa  114  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.06 
 
 
1919 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  28.41 
 
 
443 aa  113  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 
745 aa  111  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  23.32 
 
 
807 aa  108  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  29.14 
 
 
726 aa  108  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  30.3 
 
 
737 aa  107  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.03 
 
 
469 aa  107  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  30.3 
 
 
835 aa  106  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  28.31 
 
 
461 aa  105  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2789  hypothetical protein  47.93 
 
 
133 aa  105  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316078  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  27.29 
 
 
1129 aa  105  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  27.6 
 
 
461 aa  101  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  26.9 
 
 
575 aa  99  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  29.14 
 
 
590 aa  95.5  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  28.3 
 
 
396 aa  95.1  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  28.46 
 
 
728 aa  94.7  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  25.73 
 
 
499 aa  94  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  31.85 
 
 
638 aa  93.2  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  26.77 
 
 
363 aa  92.8  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  28.1 
 
 
390 aa  92.4  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  26.77 
 
 
363 aa  92.8  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  27.53 
 
 
418 aa  92  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  28.29 
 
 
328 aa  91.3  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.65 
 
 
706 aa  90.9  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  29.68 
 
 
558 aa  87  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  28.48 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  26.73 
 
 
624 aa  84.7  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  26.86 
 
 
547 aa  84.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  30.62 
 
 
783 aa  84  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 
692 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  27.71 
 
 
643 aa  81.6  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  25.81 
 
 
533 aa  79.7  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  26.72 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.62 
 
 
1126 aa  77.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  26.33 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  31.31 
 
 
332 aa  73.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  30.96 
 
 
547 aa  73.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  26.08 
 
 
727 aa  72  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.72 
 
 
454 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.6 
 
 
921 aa  70.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>