145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1193 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 
577 aa  1094    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  75 
 
 
566 aa  741    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  64.24 
 
 
567 aa  595  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  58.93 
 
 
558 aa  567  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  58.68 
 
 
553 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  57.37 
 
 
569 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  58.74 
 
 
570 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  56.6 
 
 
551 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  51.04 
 
 
558 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  53.55 
 
 
555 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  54.77 
 
 
555 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  55.05 
 
 
554 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  54.42 
 
 
579 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  53.11 
 
 
556 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  55.28 
 
 
546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  52.07 
 
 
560 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  54.23 
 
 
554 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  51.31 
 
 
563 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  49.91 
 
 
561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  55.29 
 
 
477 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  49.46 
 
 
792 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  49.2 
 
 
784 aa  257  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  42.7 
 
 
778 aa  250  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  43.36 
 
 
1848 aa  249  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  48.13 
 
 
776 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.89 
 
 
837 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.54 
 
 
417 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.95 
 
 
553 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.19 
 
 
1919 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  41.06 
 
 
593 aa  193  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.81 
 
 
1679 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  38.65 
 
 
911 aa  190  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  32.99 
 
 
2082 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  34.98 
 
 
743 aa  188  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  36.1 
 
 
714 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.15 
 
 
821 aa  186  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  36.36 
 
 
443 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.74 
 
 
818 aa  180  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  36.89 
 
 
717 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  39.53 
 
 
681 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  41.95 
 
 
376 aa  177  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  38.74 
 
 
403 aa  176  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.69 
 
 
706 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  33.83 
 
 
461 aa  171  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  40.38 
 
 
389 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  57.71 
 
 
209 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  38.52 
 
 
835 aa  166  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  38.22 
 
 
737 aa  163  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  29.87 
 
 
461 aa  163  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  34.76 
 
 
449 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.36 
 
 
469 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  34.97 
 
 
1129 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.96 
 
 
941 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  31.36 
 
 
341 aa  148  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  33.42 
 
 
726 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.24 
 
 
787 aa  146  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  30.96 
 
 
363 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  30.96 
 
 
363 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  33.15 
 
 
1207 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  34.96 
 
 
900 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  35.48 
 
 
618 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
745 aa  137  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  30.65 
 
 
807 aa  137  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  32.4 
 
 
1187 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  29.75 
 
 
602 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.68 
 
 
817 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  31.52 
 
 
624 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  29.97 
 
 
418 aa  125  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  30.03 
 
 
454 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  29.57 
 
 
547 aa  123  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.4 
 
 
535 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  32.59 
 
 
328 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  32.81 
 
 
1222 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32 
 
 
810 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  32.86 
 
 
638 aa  118  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  30.56 
 
 
728 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.78 
 
 
692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.13 
 
 
1147 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  35.44 
 
 
2816 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  31.43 
 
 
1312 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  28.9 
 
 
533 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  32.24 
 
 
547 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.05 
 
 
454 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  35.43 
 
 
332 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.72 
 
 
921 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  29.22 
 
 
447 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  26.67 
 
 
375 aa  111  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  25.6 
 
 
643 aa  111  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  28.85 
 
 
390 aa  110  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  31.94 
 
 
558 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  32.49 
 
 
544 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2494  regulator of chromosome condensation, RCC1  55.77 
 
 
209 aa  107  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  31.02 
 
 
575 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.45 
 
 
1126 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  30.59 
 
 
450 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  27.27 
 
 
727 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  24.55 
 
 
499 aa  99.4  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  29.18 
 
 
643 aa  98.2  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  25.52 
 
 
399 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.02 
 
 
326 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>