49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3963 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  100 
 
 
1083 aa  2067    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  54.25 
 
 
288 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  46.06 
 
 
791 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.23 
 
 
1292 aa  171  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  47.22 
 
 
2802 aa  168  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.62 
 
 
1183 aa  167  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  44.58 
 
 
1178 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  47.69 
 
 
633 aa  165  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.95 
 
 
1176 aa  165  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.17 
 
 
714 aa  164  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  46.43 
 
 
462 aa  164  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  46.19 
 
 
1285 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  45.41 
 
 
1848 aa  162  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  46.43 
 
 
1026 aa  161  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  42.32 
 
 
1130 aa  159  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  44.59 
 
 
701 aa  159  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.74 
 
 
1383 aa  157  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  45.83 
 
 
862 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.91 
 
 
1221 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  43.33 
 
 
3563 aa  153  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.78 
 
 
887 aa  152  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.42 
 
 
1507 aa  152  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  45.83 
 
 
1195 aa  151  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  42.08 
 
 
648 aa  151  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.83 
 
 
810 aa  150  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.91 
 
 
1126 aa  151  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.5 
 
 
826 aa  149  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.74 
 
 
1607 aa  145  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.22 
 
 
805 aa  144  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  41.84 
 
 
884 aa  142  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.5 
 
 
408 aa  141  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.61 
 
 
540 aa  140  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  39.34 
 
 
664 aa  140  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  42.8 
 
 
933 aa  137  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  36.62 
 
 
920 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  40.64 
 
 
1176 aa  132  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  37.92 
 
 
640 aa  132  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  38.4 
 
 
721 aa  129  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  40.43 
 
 
1255 aa  121  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3840  hemolysin-type calcium-binding region  31.42 
 
 
1093 aa  97.8  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0668693 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0484  hypothetical protein  36.43 
 
 
939 aa  73.6  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0960554  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1716  hemolysin-type calcium-binding region  36.31 
 
 
929 aa  70.5  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.852019  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0461  surface layer protein SapB9  38.06 
 
 
941 aa  68.9  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0481  surface array protein  30.28 
 
 
921 aa  61.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18804  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1726  hemolysin-type calcium-binding region  32.7 
 
 
1144 aa  59.3  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.57086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  35.12 
 
 
1424 aa  59.3  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  30.17 
 
 
830 aa  52.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  29.79 
 
 
589 aa  48.9  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1525  rhizobiocin/RTX toxin  36.19 
 
 
301 aa  45.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>