More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1416 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  100 
 
 		 1424 aa  2757    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  51.29 
 
 		 946 aa  230  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  40.67 
 
 		 1534 aa  225  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.37 
 
 		 3427 aa  212  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  45.25 
 
 		 1279 aa  210  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  44 
 
 		 1079 aa  208  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.09 
 
 		 2678 aa  208  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.24 
 
 		 1795 aa  204  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  42.71 
 
 		 3954 aa  202  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  40.53 
 
 		 2911 aa  201  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  40.25 
 
 		 1532 aa  198  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  48.38 
 
 		 2105 aa  196  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  36.83 
 
 		 595 aa  194  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  45.02 
 
 		 833 aa  192  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  38.95 
 
 		 1499 aa  191  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  52.44 
 
 		 1164 aa  191  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  41.64 
 
 		 1895 aa  191  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  41.97 
 
 		 2954 aa  189  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  44.85 
 
 		 2775 aa  187  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.17 
 
 		 1236 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  44.3 
 
 		 3619 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  40.6 
 
 		 613 aa  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  33.39 
 
 		 3209 aa  184  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  40.49 
 
 		 556 aa  184  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  36.78 
 
 		 9867 aa  184  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  43.57 
 
 		 3619 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  42.15 
 
 		 1400 aa  182  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  37.76 
 
 		 526 aa  178  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  42.68 
 
 		 1884 aa  178  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.62 
 
 		 980 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  45.94 
 
 		 4334 aa  177  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  34.01 
 
 		 1855 aa  177  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  42.77 
 
 		 745 aa  173  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.41 
 
 		 2668 aa  173  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  44.21 
 
 		 2689 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  44.56 
 
 		 2145 aa  171  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.19 
 
 		 2667 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.19 
 
 		 1363 aa  170  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  44.83 
 
 		 615 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  42.6 
 
 		 965 aa  167  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  37.58 
 
 		 4800 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  42.35 
 
 		 1287 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  49.16 
 
 		 460 aa  166  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  48.29 
 
 		 824 aa  166  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  39.63 
 
 		 3608 aa  163  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  40.17 
 
 		 387 aa  163  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.89 
 
 		 588 aa  163  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  48.55 
 
 		 589 aa  162  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  45.53 
 
 		 363 aa  162  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  46.23 
 
 		 850 aa  160  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  44.3 
 
 		 341 aa  160  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  52.45 
 
 		 982 aa  160  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  30.54 
 
 		 1156 aa  157  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  45.65 
 
 		 491 aa  157  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  40.7 
 
 		 1712 aa  153  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  50.52 
 
 		 5171 aa  150  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  41.53 
 
 		 341 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  42.34 
 
 		 2097 aa  150  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  38.75 
 
 		 387 aa  148  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 2836 aa  148  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  29.28 
 
 		 1864 aa  147  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  38.7 
 
 		 393 aa  147  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  40.88 
 
 		 820 aa  146  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 396 aa  145  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  39.4 
 
 		 437 aa  145  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  57.4 
 
 		 260 aa  144  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  42.59 
 
 		 460 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  51.05 
 
 		 757 aa  143  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.49 
 
 		 1963 aa  143  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  51.38 
 
 		 813 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  53.09 
 
 		 709 aa  140  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  41.58 
 
 		 4687 aa  139  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  45.41 
 
 		 639 aa  139  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  48.09 
 
 		 795 aa  139  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  54.32 
 
 		 421 aa  138  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  34.84 
 
 		 3598 aa  138  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  47.16 
 
 		 437 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  47.91 
 
 		 1043 aa  137  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  34.88 
 
 		 1197 aa  136  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  32.14 
 
 		 589 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  45.95 
 
 		 686 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.26 
 
 		 1016 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  40.41 
 
 		 1145 aa  133  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  32.7 
 
 		 1582 aa  134  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  38.05 
 
 		 724 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  49.5 
 
 		 355 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  36.24 
 
 		 1072 aa  131  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  36.04 
 
 		 518 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  45.16 
 
 		 648 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  50.72 
 
 		 1544 aa  129  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  37.16 
 
 		 1383 aa  129  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  36.17 
 
 		 1480 aa  129  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  40.87 
 
 		 950 aa  129  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  43.56 
 
 		 1883 aa  129  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  46.82 
 
 		 2885 aa  129  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  43.4 
 
 		 219 aa  129  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  43.62 
 
 		 357 aa  128  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  48.26 
 
 		 243 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  43.56 
 
 		 361 aa  127  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  36.61 
 
 		 769 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>