129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0638 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  100 
 
 
1285 aa  2514    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.18 
 
 
1383 aa  309  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  54.51 
 
 
2802 aa  305  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  57.63 
 
 
1607 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  57.3 
 
 
633 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  57.66 
 
 
1126 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  57.89 
 
 
1026 aa  300  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.61 
 
 
805 aa  295  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  57.88 
 
 
714 aa  294  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  58.24 
 
 
810 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.22 
 
 
1221 aa  288  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  52.63 
 
 
1848 aa  288  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.74 
 
 
826 aa  288  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  52.54 
 
 
1176 aa  285  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  57.2 
 
 
1178 aa  284  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  53 
 
 
1255 aa  284  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  56.32 
 
 
1195 aa  281  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.17 
 
 
1130 aa  278  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  50.94 
 
 
920 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.21 
 
 
1183 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.18 
 
 
887 aa  275  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  52.76 
 
 
884 aa  275  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.69 
 
 
1176 aa  273  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  48.45 
 
 
721 aa  272  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.89 
 
 
540 aa  269  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  51.95 
 
 
1292 aa  260  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  50.34 
 
 
701 aa  259  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.22 
 
 
408 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  49.82 
 
 
462 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.96 
 
 
1507 aa  254  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  47.42 
 
 
640 aa  252  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  49.64 
 
 
791 aa  244  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  46.81 
 
 
862 aa  237  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.4 
 
 
664 aa  235  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  51.75 
 
 
933 aa  225  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  38.28 
 
 
1152 aa  221  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  46.48 
 
 
648 aa  215  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  45.49 
 
 
288 aa  204  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  41.28 
 
 
3563 aa  183  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  31.85 
 
 
1219 aa  182  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  30.24 
 
 
1406 aa  180  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  30.85 
 
 
846 aa  167  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  32.8 
 
 
846 aa  165  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  46.19 
 
 
1083 aa  162  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  30.1 
 
 
846 aa  142  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  30 
 
 
848 aa  134  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  36.88 
 
 
1146 aa  132  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  37.79 
 
 
1047 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.42 
 
 
12684 aa  115  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  31.18 
 
 
1127 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  42.31 
 
 
1054 aa  112  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  31.65 
 
 
1127 aa  111  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  34.77 
 
 
482 aa  110  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  32.66 
 
 
675 aa  109  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  25.74 
 
 
14944 aa  109  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  30.82 
 
 
1127 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  39.11 
 
 
1053 aa  106  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 
1129 aa  107  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  34.28 
 
 
1362 aa  105  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  38.61 
 
 
1051 aa  105  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 
1127 aa  104  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  30.29 
 
 
1096 aa  102  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  35.96 
 
 
499 aa  95.5  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  31.62 
 
 
1123 aa  93.6  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.74 
 
 
984 aa  85.5  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  29.2 
 
 
1059 aa  84.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  27.16 
 
 
1457 aa  82.4  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  30 
 
 
1204 aa  81.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  24.27 
 
 
962 aa  81.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  44.55 
 
 
703 aa  79.7  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  29.32 
 
 
1452 aa  77  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  30.85 
 
 
1141 aa  75.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  45.65 
 
 
991 aa  75.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0591  putative chitinase  34.97 
 
 
306 aa  73.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  35.98 
 
 
1247 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  28 
 
 
14609 aa  68.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 
1224 aa  69.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  38.61 
 
 
1132 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  48.78 
 
 
1414 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  35.98 
 
 
1217 aa  66.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  30.05 
 
 
827 aa  65.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.51 
 
 
587 aa  65.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  31.9 
 
 
343 aa  65.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  27.02 
 
 
5743 aa  65.1  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  35.35 
 
 
1585 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  36.94 
 
 
778 aa  64.3  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  35.98 
 
 
1474 aa  63.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  44.35 
 
 
974 aa  62.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  41.07 
 
 
1031 aa  62.4  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.33 
 
 
979 aa  62.4  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.94 
 
 
915 aa  59.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  37.89 
 
 
1275 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  27.31 
 
 
3562 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 
612 aa  57.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.98 
 
 
626 aa  57.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.88 
 
 
1143 aa  57.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  27.41 
 
 
2656 aa  57.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 
1578 aa  57.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  31.58 
 
 
1295 aa  56.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  41.46 
 
 
963 aa  56.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>