47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4304 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  100 
 
 
920 aa  1869    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
1601 aa  516  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  46.07 
 
 
861 aa  504  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  46.74 
 
 
1294 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0097  beta-mannanase/endoglucanase A  45.57 
 
 
563 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0700472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  59.32 
 
 
721 aa  436  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  64.2 
 
 
540 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  59.38 
 
 
408 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  58.67 
 
 
1255 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  57.22 
 
 
640 aa  402  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  56.33 
 
 
714 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.08 
 
 
826 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  56.44 
 
 
810 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  52.96 
 
 
1026 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  57.59 
 
 
1126 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  56.5 
 
 
1178 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.18 
 
 
805 aa  363  9e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  53.68 
 
 
701 aa  348  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  53.42 
 
 
633 aa  347  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.54 
 
 
664 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  51.68 
 
 
2802 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  51.96 
 
 
1848 aa  328  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.71 
 
 
1221 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  51.59 
 
 
3563 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  48.76 
 
 
884 aa  316  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.72 
 
 
1607 aa  313  5.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.76 
 
 
1383 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  49.72 
 
 
1195 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.14 
 
 
1130 aa  308  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.24 
 
 
1507 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.56 
 
 
1183 aa  295  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  47.55 
 
 
1176 aa  293  7e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  50.94 
 
 
1285 aa  277  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.61 
 
 
887 aa  270  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  43.65 
 
 
791 aa  257  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.66 
 
 
1292 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  42.62 
 
 
862 aa  254  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.17 
 
 
1176 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  42.34 
 
 
933 aa  231  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  40.87 
 
 
462 aa  228  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  43.64 
 
 
648 aa  206  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3062  hypothetical protein  31.85 
 
 
711 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0227805  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  37.63 
 
 
288 aa  160  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  36.62 
 
 
1083 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1503  hypothetical protein  25.59 
 
 
761 aa  128  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4317  hypothetical protein  24.13 
 
 
620 aa  88.6  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1570  hypothetical protein  23.91 
 
 
632 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475185  normal  0.622551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>