175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4610 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 721 aa  1461    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  62.1 
 
 		 540 aa  452  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  59.32 
 
 		 920 aa  435  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  60.59 
 
 		 714 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  58.24 
 
 		 1255 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  56.15 
 
 		 408 aa  402  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  56.4 
 
 		 640 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.71 
 
 		 826 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  56.52 
 
 		 810 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  54.26 
 
 		 1178 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  52.52 
 
 		 1026 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  53.85 
 
 		 633 aa  356  6.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  53.8 
 
 		 997 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.46 
 
 		 1126 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.33 
 
 		 805 aa  350  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  49.28 
 
 		 325 aa  347  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.8 
 
 		 664 aa  343  8e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  49.36 
 
 		 701 aa  331  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  50 
 
 		 1221 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.66 
 
 		 1383 aa  330  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03861  glycosyl hydrolase family 10  50.3 
 
 		 325 aa  330  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  50.44 
 
 		 2802 aa  326  8.000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  47.45 
 
 		 884 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  49.72 
 
 		 1848 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.79 
 
 		 1130 aa  313  5.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.83 
 
 		 1607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  47.14 
 
 		 1195 aa  304  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.38 
 
 		 1183 aa  301  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.03 
 
 		 1507 aa  299  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  49.41 
 
 		 3563 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  43.3 
 
 		 1176 aa  287  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.04 
 
 		 887 aa  283  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.7 
 
 		 1292 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  48.45 
 
 		 1285 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  42.09 
 
 		 791 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03863  glycosyl hydrolase family 10  49.26 
 
 		 271 aa  272  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  43.06 
 
 		 862 aa  267  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  38.57 
 
 		 541 aa  257  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.69 
 
 		 1176 aa  250  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  42.35 
 
 		 462 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  42.31 
 
 		 933 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  38.74 
 
 		 574 aa  221  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  39.29 
 
 		 1186 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  42.81 
 
 		 648 aa  210  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  34.67 
 
 		 1247 aa  179  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.11 
 
 		 1414 aa  174  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  39.1 
 
 		 288 aa  171  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  38.4 
 
 		 1083 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  28.65 
 
 		 488 aa  114  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  30.25 
 
 		 820 aa  103  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  30.03 
 
 		 491 aa  102  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  31.45 
 
 		 454 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  28.24 
 
 		 423 aa  98.2  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  27.14 
 
 		 815 aa  97.4  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  27.39 
 
 		 674 aa  97.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 678 aa  95.5  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  29.01 
 
 		 503 aa  95.1  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  27.37 
 
 		 398 aa  94.7  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  27.67 
 
 		 347 aa  94.7  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  26.48 
 
 		 337 aa  94.4  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  28.78 
 
 		 497 aa  93.2  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  27.51 
 
 		 543 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  29.21 
 
 		 474 aa  93.2  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  27 
 
 		 477 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  28.03 
 
 		 487 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  26.79 
 
 		 321 aa  90.9  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  26.73 
 
 		 347 aa  90.9  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  28.67 
 
 		 333 aa  90.1  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  29.08 
 
 		 495 aa  89.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  28.43 
 
 		 474 aa  89  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  28.36 
 
 		 371 aa  87.8  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  30.27 
 
 		 1019 aa  86.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  28.67 
 
 		 1018 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  24.31 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  26.3 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  28.06 
 
 		 756 aa  84.7  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  28.73 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  25.16 
 
 		 463 aa  84  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  26.64 
 
 		 778 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  27.5 
 
 		 829 aa  83.2  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  26.25 
 
 		 1001 aa  82.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  26.39 
 
 		 689 aa  82.4  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  26.43 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  27.21 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  25.6 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  28.57 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  30.77 
 
 		 770 aa  80.1  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 		 837 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  29.47 
 
 		 619 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  28.8 
 
 		 912 aa  79  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  27.44 
 
 		 1495 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  28.37 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  28.67 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 639 aa  77.4  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  24.14 
 
 		 359 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  25.42 
 
 		 407 aa  77  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  24.93 
 
 		 2457 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  26.25 
 
 		 1050 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  27.9 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>