140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0550 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 398 aa  820    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  64.4 
 
 		 399 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  65.52 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  59.29 
 
 		 383 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  57.36 
 
 		 376 aa  362  8e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  47.38 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  42.19 
 
 		 389 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  44.35 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  42.82 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  46.49 
 
 		 474 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  45.56 
 
 		 543 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  43.89 
 
 		 347 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  45.36 
 
 		 477 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  43.23 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  41.02 
 
 		 373 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  39.89 
 
 		 628 aa  252  9.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  37.13 
 
 		 837 aa  249  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  41.41 
 
 		 488 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  43.71 
 
 		 333 aa  236  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  40.53 
 
 		 317 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  41.16 
 
 		 678 aa  230  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  41.81 
 
 		 487 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  37.22 
 
 		 778 aa  225  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  33.78 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  40.55 
 
 		 490 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  35.28 
 
 		 503 aa  219  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  40.24 
 
 		 451 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  38.02 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  36.95 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  40.73 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  38 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  38.31 
 
 		 829 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  35.06 
 
 		 497 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  34.33 
 
 		 465 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  33.85 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  32.72 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  36.83 
 
 		 1037 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.65 
 
 		 697 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  35.95 
 
 		 457 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  35.48 
 
 		 815 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  34.09 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  33.55 
 
 		 474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  32.36 
 
 		 321 aa  173  5e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  33.83 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  32.26 
 
 		 820 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  34.84 
 
 		 1478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  31.4 
 
 		 369 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  36.17 
 
 		 359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  34.65 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  35.27 
 
 		 472 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  36 
 
 		 1001 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  30.77 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  31.18 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  34.39 
 
 		 756 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  34.8 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  38.16 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  33.45 
 
 		 309 aa  159  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  35.99 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  31.78 
 
 		 689 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  34.97 
 
 		 370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  29.15 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  33.58 
 
 		 321 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  32.47 
 
 		 451 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  33.82 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  29.77 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  32.6 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  33.57 
 
 		 337 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  31.2 
 
 		 566 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  34.16 
 
 		 463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  35.87 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  32.46 
 
 		 1041 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  34.7 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  32.75 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  35.88 
 
 		 1019 aa  143  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  31.12 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  31.71 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  34.88 
 
 		 1059 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  34.88 
 
 		 1059 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  32.74 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  29.3 
 
 		 619 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  30.74 
 
 		 1018 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  29.45 
 
 		 561 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 		 619 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  29.31 
 
 		 756 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.94 
 
 		 1146 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  29.94 
 
 		 912 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  31.15 
 
 		 1020 aa  120  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  30.93 
 
 		 690 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  32.92 
 
 		 1780 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  34.19 
 
 		 1331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  32.22 
 
 		 1215 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.23 
 
 		 770 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  27.35 
 
 		 1050 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 1077 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  27.68 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  28.44 
 
 		 498 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  28.66 
 
 		 806 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>