164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1549 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  71.63 
 
 		 1059 aa  1492    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  50 
 
 		 1041 aa  1026    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  71.53 
 
 		 1059 aa  1489    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 1020 aa  2091    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  45.25 
 
 		 1037 aa  865    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  32.89 
 
 		 1018 aa  539  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.37 
 
 		 697 aa  502  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  31.59 
 
 		 1019 aa  425  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  35.71 
 
 		 689 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  53.47 
 
 		 1478 aa  362  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  31.08 
 
 		 1780 aa  360  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  29.47 
 
 		 1215 aa  343  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  33.16 
 
 		 1050 aa  328  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.99 
 
 		 1146 aa  322  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  30.27 
 
 		 1495 aa  287  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  46.85 
 
 		 323 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  43.45 
 
 		 331 aa  272  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  30.01 
 
 		 912 aa  266  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  32.85 
 
 		 756 aa  263  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  33.97 
 
 		 619 aa  257  8e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  41.42 
 
 		 366 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  33.33 
 
 		 690 aa  249  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  41.74 
 
 		 321 aa  244  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  41 
 
 		 338 aa  244  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  39.03 
 
 		 423 aa  240  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  40.88 
 
 		 359 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  41.12 
 
 		 337 aa  231  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  36.84 
 
 		 374 aa  230  9e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  37.92 
 
 		 324 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  29.84 
 
 		 1331 aa  227  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  35.77 
 
 		 407 aa  214  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  54.08 
 
 		 215 aa  210  8e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  34.66 
 
 		 370 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  29.79 
 
 		 1077 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  37.39 
 
 		 382 aa  201  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  29.98 
 
 		 806 aa  189  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  34.28 
 
 		 369 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  35.8 
 
 		 333 aa  184  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  36.91 
 
 		 837 aa  181  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  34.04 
 
 		 2457 aa  178  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  37.62 
 
 		 371 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  36.54 
 
 		 347 aa  173  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  34.74 
 
 		 328 aa  172  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  35.88 
 
 		 347 aa  171  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  38.16 
 
 		 474 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  33.23 
 
 		 457 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  45.6 
 
 		 2286 aa  162  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  32.23 
 
 		 423 aa  161  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  34.68 
 
 		 815 aa  161  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  33.56 
 
 		 495 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  33.23 
 
 		 497 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  27.41 
 
 		 1242 aa  156  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  34.48 
 
 		 820 aa  155  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  34.47 
 
 		 491 aa  154  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  33.53 
 
 		 474 aa  154  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  32.24 
 
 		 463 aa  153  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  35.64 
 
 		 503 aa  152  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  35.69 
 
 		 488 aa  148  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  32.67 
 
 		 389 aa  147  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  31.23 
 
 		 373 aa  147  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  32.58 
 
 		 399 aa  146  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  33.87 
 
 		 454 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  34.02 
 
 		 619 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  32.29 
 
 		 388 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  35.02 
 
 		 1001 aa  144  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 		 678 aa  144  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  34.35 
 
 		 472 aa  144  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  42.71 
 
 		 691 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  27.36 
 
 		 490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  32.24 
 
 		 364 aa  142  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  34.02 
 
 		 383 aa  142  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  32.7 
 
 		 457 aa  140  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  29.88 
 
 		 477 aa  140  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  41.75 
 
 		 451 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  33.78 
 
 		 829 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  34.71 
 
 		 756 aa  139  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  29.17 
 
 		 487 aa  138  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  34.81 
 
 		 451 aa  138  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  32.62 
 
 		 309 aa  138  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  28.34 
 
 		 387 aa  137  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  33.33 
 
 		 778 aa  137  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  29.78 
 
 		 486 aa  135  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0809  glycoside hydrolase family 10  26.21 
 
 		 627 aa  134  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 401 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  33.47 
 
 		 317 aa  134  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  30.9 
 
 		 628 aa  134  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  32.05 
 
 		 370 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 		 639 aa  132  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  31.23 
 
 		 368 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  32.77 
 
 		 770 aa  130  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  31.23 
 
 		 376 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  33.79 
 
 		 370 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  34.22 
 
 		 394 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  30.48 
 
 		 375 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  33.67 
 
 		 543 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  29.53 
 
 		 520 aa  127  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  29.1 
 
 		 465 aa  122  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  28.43 
 
 		 566 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  30.43 
 
 		 373 aa  120  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  34.7 
 
 		 321 aa  120  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>