More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2139 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  100 
 
 
474 aa  973    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  55.01 
 
 
451 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  51.74 
 
 
491 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  53.88 
 
 
477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  50.34 
 
 
488 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  49.35 
 
 
487 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  47.05 
 
 
503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  53.37 
 
 
490 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  55.39 
 
 
678 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  56.64 
 
 
371 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  52.52 
 
 
778 aa  357  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  47.37 
 
 
457 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  48.74 
 
 
457 aa  343  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  43.46 
 
 
474 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  45.65 
 
 
829 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  46.67 
 
 
454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  56.05 
 
 
543 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  46.1 
 
 
756 aa  330  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  42.93 
 
 
628 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  48.9 
 
 
837 aa  323  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  53.67 
 
 
495 aa  322  8e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  45.4 
 
 
347 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  45.4 
 
 
347 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  43.86 
 
 
373 aa  316  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  45.64 
 
 
820 aa  309  8e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  43.3 
 
 
423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  43.71 
 
 
472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  46.28 
 
 
383 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  45.08 
 
 
451 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  42.57 
 
 
399 aa  296  6e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  52.83 
 
 
497 aa  296  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  44.79 
 
 
394 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  47.08 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  46.49 
 
 
398 aa  282  8.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  41.75 
 
 
815 aa  282  9e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  43.14 
 
 
376 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  45.9 
 
 
321 aa  277  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  41.92 
 
 
389 aa  270  5e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  41.22 
 
 
1001 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  45.02 
 
 
309 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  41.38 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  42.42 
 
 
355 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  44.9 
 
 
370 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  39.38 
 
 
328 aa  233  6e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  40.68 
 
 
323 aa  232  9e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  39.62 
 
 
317 aa  227  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  41.09 
 
 
366 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  38.11 
 
 
359 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  37.17 
 
 
423 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  39.27 
 
 
370 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  39.19 
 
 
1037 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  35.44 
 
 
369 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  38.41 
 
 
338 aa  206  9e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.65 
 
 
697 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34.28 
 
 
1041 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  37.77 
 
 
1478 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  37.39 
 
 
689 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  37.54 
 
 
324 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  34.94 
 
 
331 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  39.39 
 
 
1019 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  35.89 
 
 
1059 aa  193  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  35.89 
 
 
1059 aa  193  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 
364 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  36.34 
 
 
381 aa  190  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  35.58 
 
 
357 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  34.66 
 
 
337 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  31.53 
 
 
407 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  38.16 
 
 
1020 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 
321 aa  179  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  29.58 
 
 
373 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  33.8 
 
 
374 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  34.66 
 
 
465 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  38.64 
 
 
619 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  34.13 
 
 
1050 aa  176  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  34.2 
 
 
486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  31.46 
 
 
401 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  33.52 
 
 
357 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 
382 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  36.36 
 
 
1018 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  33.22 
 
 
387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  37.27 
 
 
382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  32.51 
 
 
756 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  35.05 
 
 
370 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  33.44 
 
 
368 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  32.31 
 
 
357 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  31.27 
 
 
463 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  33.66 
 
 
388 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  30.97 
 
 
1495 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  32.79 
 
 
1077 aa  150  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  31.46 
 
 
912 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.94 
 
 
770 aa  147  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  31.23 
 
 
392 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  34.34 
 
 
1780 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  63.11 
 
 
847 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  69.7 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 
619 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.4 
 
 
1146 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  64.65 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  31.21 
 
 
561 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  33.01 
 
 
690 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>