More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0935 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  51.45 
 
 		 1017 aa  730    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  61.04 
 
 		 880 aa  965    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  63 
 
 		 1137 aa  792    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.91 
 
 		 887 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  51.78 
 
 		 1759 aa  648    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  51.03 
 
 		 794 aa  781    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  66.45 
 
 		 990 aa  823    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  57.11 
 
 		 846 aa  917    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  100 
 
 		 847 aa  1726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  52.04 
 
 		 739 aa  623  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.84 
 
 		 985 aa  619  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  47.77 
 
 		 725 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  47.74 
 
 		 737 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  47.47 
 
 		 730 aa  554  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  46.24 
 
 		 736 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  46.76 
 
 		 710 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  45.43 
 
 		 1369 aa  519  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  42.11 
 
 		 715 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  39.22 
 
 		 742 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  35.55 
 
 		 707 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  33.13 
 
 		 984 aa  336  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  36.62 
 
 		 686 aa  330  8e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  33.14 
 
 		 757 aa  324  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  38.1 
 
 		 526 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  33.07 
 
 		 928 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  31.35 
 
 		 949 aa  315  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  39.5 
 
 		 563 aa  305  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 961 aa  301  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  32.37 
 
 		 789 aa  297  6e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  30.84 
 
 		 778 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  34.65 
 
 		 611 aa  264  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  33.63 
 
 		 854 aa  261  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  32.6 
 
 		 894 aa  261  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  63.86 
 
 		 978 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  32.59 
 
 		 590 aa  196  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  53.12 
 
 		 523 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  54.19 
 
 		 543 aa  164  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  31.34 
 
 		 2042 aa  162  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  30.35 
 
 		 978 aa  161  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  48.47 
 
 		 608 aa  157  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  42.19 
 
 		 438 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  44.56 
 
 		 543 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  49.75 
 
 		 460 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.5 
 
 		 681 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  64 
 
 		 474 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  64.65 
 
 		 448 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  45.9 
 
 		 658 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.62 
 
 		 998 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  47.42 
 
 		 973 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  46.97 
 
 		 649 aa  128  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  40.1 
 
 		 743 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  40.09 
 
 		 1121 aa  125  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 727 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  39.59 
 
 		 429 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  42.58 
 
 		 655 aa  120  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  43.75 
 
 		 900 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  57 
 
 		 460 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  50.51 
 
 		 456 aa  108  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  51.52 
 
 		 422 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  34.69 
 
 		 637 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  49.5 
 
 		 360 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  44.83 
 
 		 773 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  53.4 
 
 		 449 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  34.72 
 
 		 699 aa  101  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  52.34 
 
 		 499 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  53.47 
 
 		 353 aa  99  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  47.47 
 
 		 372 aa  99  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  49.04 
 
 		 491 aa  97.8  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  37.93 
 
 		 1007 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  32.07 
 
 		 674 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  49 
 
 		 437 aa  96.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  47.83 
 
 		 486 aa  96.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  30.98 
 
 		 674 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  30.43 
 
 		 674 aa  95.1  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  50.54 
 
 		 593 aa  95.1  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  41.67 
 
 		 455 aa  95.1  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  48.19 
 
 		 925 aa  94  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  43.75 
 
 		 913 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  48.04 
 
 		 441 aa  93.2  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  38.31 
 
 		 719 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  49.46 
 
 		 1055 aa  92.4  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  29.89 
 
 		 674 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  46.81 
 
 		 609 aa  92.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  47.31 
 
 		 906 aa  92.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  29.89 
 
 		 674 aa  92  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  29.89 
 
 		 674 aa  92  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  46.6 
 
 		 681 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  48.54 
 
 		 477 aa  92  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  29.89 
 
 		 674 aa  92  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 358 aa  92  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  37.63 
 
 		 385 aa  91.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  47.22 
 
 		 493 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  32.83 
 
 		 679 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  28 
 
 		 674 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  49.49 
 
 		 673 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  41.84 
 
 		 347 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 		 854 aa  89.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  54.05 
 
 		 359 aa  89.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  48 
 
 		 763 aa  88.2  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  30.27 
 
 		 674 aa  88.6  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>