262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1493 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  100 
 
 		 1055 aa  2161    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  38.94 
 
 		 811 aa  328  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  33.13 
 
 		 1042 aa  286  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0031  Protein of unknown function DUF1592  34.4 
 
 		 570 aa  281  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  32.08 
 
 		 2172 aa  217  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  26.47 
 
 		 1113 aa  209  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0129  Protein of unknown function DUF1592  31.39 
 
 		 667 aa  196  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.609629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5967  Protein of unknown function DUF1592  31.76 
 
 		 561 aa  188  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0287  Protein of unknown function DUF1592  28.87 
 
 		 919 aa  170  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0931  Protein of unknown function DUF1592  30.82 
 
 		 868 aa  169  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  27.01 
 
 		 778 aa  157  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0568  Protein of unknown function DUF1592  30.5 
 
 		 818 aa  154  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  40.11 
 
 		 846 aa  131  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  45.39 
 
 		 812 aa  125  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3241  Protein of unknown function DUF1588  28.6 
 
 		 866 aa  123  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  40.22 
 
 		 633 aa  120  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  49.53 
 
 		 746 aa  117  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  43.38 
 
 		 609 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  48.78 
 
 		 794 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.57 
 
 		 984 aa  112  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  39.53 
 
 		 486 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  37.65 
 
 		 773 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 		 854 aa  108  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  49 
 
 		 596 aa  107  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  48.11 
 
 		 913 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  50.46 
 
 		 499 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  36.78 
 
 		 455 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  53.47 
 
 		 774 aa  107  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  47.66 
 
 		 488 aa  106  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  42.59 
 
 		 974 aa  107  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  44.55 
 
 		 744 aa  105  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0049  cellulose-binding domain-containing protein  46.08 
 
 		 740 aa  105  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  44.3 
 
 		 942 aa  104  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  44.35 
 
 		 743 aa  104  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  50.49 
 
 		 489 aa  104  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  45.28 
 
 		 681 aa  104  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  47.62 
 
 		 934 aa  103  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.08 
 
 		 491 aa  103  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  38.28 
 
 		 669 aa  102  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  46.3 
 
 		 543 aa  103  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  49.57 
 
 		 474 aa  102  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.51 
 
 		 588 aa  101  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.04 
 
 		 979 aa  102  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  49 
 
 		 590 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  42.41 
 
 		 694 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  46.36 
 
 		 423 aa  99.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  45.19 
 
 		 623 aa  98.6  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  49.04 
 
 		 906 aa  98.2  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  41.96 
 
 		 785 aa  97.8  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  45.28 
 
 		 681 aa  97.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  44.86 
 
 		 690 aa  96.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  45.19 
 
 		 842 aa  96.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  50 
 
 		 847 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  37.5 
 
 		 605 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  44.86 
 
 		 854 aa  95.9  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  46.08 
 
 		 778 aa  95.5  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.04 
 
 		 479 aa  95.1  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 1128 aa  95.1  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  47.66 
 
 		 495 aa  94.7  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  41.74 
 
 		 842 aa  94.7  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  37.31 
 
 		 767 aa  94.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  42.31 
 
 		 628 aa  94.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  46.23 
 
 		 880 aa  93.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  44.23 
 
 		 597 aa  92.8  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  45.28 
 
 		 436 aa  92.8  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  47.25 
 
 		 448 aa  91.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  42 
 
 		 469 aa  91.7  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  42.16 
 
 		 990 aa  91.7  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  32.38 
 
 		 1194 aa  91.7  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  42.72 
 
 		 429 aa  91.3  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  42.57 
 
 		 611 aa  90.9  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.06 
 
 		 646 aa  90.9  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 		 963 aa  91.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  44.55 
 
 		 420 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.48 
 
 		 437 aa  89.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  41.9 
 
 		 494 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  45.45 
 
 		 460 aa  89.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  27.59 
 
 		 2305 aa  89  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 		 966 aa  89.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  43.14 
 
 		 688 aa  89  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  38.61 
 
 		 894 aa  89  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.74 
 
 		 998 aa  88.2  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  42.72 
 
 		 864 aa  88.2  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  42.31 
 
 		 925 aa  88.2  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  37.72 
 
 		 875 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  47.52 
 
 		 620 aa  87.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  44.79 
 
 		 485 aa  87.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  31.6 
 
 		 613 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  43.4 
 
 		 851 aa  87  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  40.2 
 
 		 518 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  45.98 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  44.34 
 
 		 775 aa  86.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  43.56 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  45.98 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  31.58 
 
 		 514 aa  85.5  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  37.25 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  49.45 
 
 		 1209 aa  85.1  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  41.51 
 
 		 580 aa  85.1  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  42 
 
 		 366 aa  84  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  33.13 
 
 		 792 aa  84.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>