151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1335 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  100 
 
 		 2042 aa  3996    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  72.77 
 
 		 978 aa  1310    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  43.58 
 
 		 1439 aa  204  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  35.86 
 
 		 2690 aa  194  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1585 aa  184  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  38.22 
 
 		 1588 aa  182  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  38.29 
 
 		 2636 aa  180  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.54 
 
 		 985 aa  176  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.2 
 
 		 887 aa  173  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 		 730 aa  166  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  48.64 
 
 		 2192 aa  166  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  32.13 
 
 		 526 aa  159  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  42.92 
 
 		 2042 aa  159  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  29.5 
 
 		 739 aa  158  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  31.75 
 
 		 847 aa  157  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  29.8 
 
 		 1759 aa  157  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  29.31 
 
 		 725 aa  157  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  29.42 
 
 		 736 aa  155  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  33.26 
 
 		 563 aa  155  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  30.06 
 
 		 686 aa  154  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1067 aa  152  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  29.62 
 
 		 1369 aa  152  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  28.33 
 
 		 880 aa  150  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 707 aa  149  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  29.96 
 
 		 846 aa  149  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  29.5 
 
 		 990 aa  147  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  28.2 
 
 		 1017 aa  145  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 		 742 aa  142  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  29.53 
 
 		 794 aa  142  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  34.24 
 
 		 2476 aa  137  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 611 aa  136  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  36.24 
 
 		 2503 aa  135  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.54 
 
 		 3699 aa  131  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  36.32 
 
 		 3699 aa  129  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  33.05 
 
 		 1526 aa  128  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  35.59 
 
 		 2522 aa  127  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  29.64 
 
 		 1137 aa  126  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  26.6 
 
 		 737 aa  124  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  34.35 
 
 		 3544 aa  123  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  28.29 
 
 		 984 aa  123  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  27.47 
 
 		 715 aa  122  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 		 710 aa  122  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  26.92 
 
 		 1300 aa  122  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  28.9 
 
 		 778 aa  119  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  27.66 
 
 		 854 aa  115  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 		 789 aa  115  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  28.79 
 
 		 4630 aa  108  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  24.84 
 
 		 949 aa  103  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 894 aa  99.8  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  27.89 
 
 		 1279 aa  95.9  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  24.42 
 
 		 961 aa  95.9  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  25.7 
 
 		 1361 aa  93.2  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  55.86 
 
 		 2927 aa  88.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  25.99 
 
 		 3793 aa  88.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  27.47 
 
 		 1316 aa  86.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  27.53 
 
 		 1532 aa  86.7  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  26.42 
 
 		 1100 aa  84.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  26.01 
 
 		 646 aa  85.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  24.73 
 
 		 591 aa  82.4  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  26.91 
 
 		 854 aa  82  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  23.04 
 
 		 621 aa  80.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  25.58 
 
 		 833 aa  80.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  24.8 
 
 		 885 aa  79.7  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  26.02 
 
 		 864 aa  79.7  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.79 
 
 		 927 aa  79.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  28.9 
 
 		 1048 aa  77  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.68 
 
 		 998 aa  77  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  30.48 
 
 		 331 aa  77  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  26.28 
 
 		 571 aa  75.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  32.22 
 
 		 846 aa  74.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 		 1224 aa  73.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  41.59 
 
 		 3089 aa  72.8  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  37.88 
 
 		 1288 aa  72.4  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  23.87 
 
 		 906 aa  71.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3328  Ig domain-containing protein  34.17 
 
 		 878 aa  72  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.5 
 
 		 762 aa  70.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  26.01 
 
 		 874 aa  70.5  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  23.28 
 
 		 812 aa  69.3  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  30.92 
 
 		 757 aa  68.9  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  48.31 
 
 		 475 aa  68.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  25.87 
 
 		 981 aa  67.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  45.45 
 
 		 1911 aa  66.6  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.91 
 
 		 786 aa  66.2  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  35.38 
 
 		 2262 aa  65.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  25.55 
 
 		 578 aa  65.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 895 aa  65.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 		 649 aa  64.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 928 aa  64.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  25 
 
 		 851 aa  64.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1969 aa  62.4  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  32.74 
 
 		 1657 aa  61.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  38.68 
 
 		 1821 aa  60.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3414  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1000 aa  60.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.789189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.32 
 
 		 611 aa  60.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  25.6 
 
 		 775 aa  60.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.26 
 
 		 900 aa  59.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  36.28 
 
 		 4071 aa  59.3  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  48.84 
 
 		 1848 aa  59.3  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  33.33 
 
 		 1295 aa  58.9  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  34.8 
 
 		 570 aa  58.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>