13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3328 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3328  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 878 aa  1793    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  31.28 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  34.17 
 
 		 2042 aa  72  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1030 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  29.23 
 
 		 479 aa  60.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  28.68 
 
 		 910 aa  53.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3665  hypothetical protein  25.48 
 
 		 973 aa  51.2  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168123  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  31.45 
 
 		 1300 aa  50.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  40.66 
 
 		 1526 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  35.48 
 
 		 981 aa  48.5  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  31.21 
 
 		 4630 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1439 aa  45.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  24.62 
 
 		 1831 aa  44.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>