More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2176 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  100 
 
 		 880 aa  1801    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  58.35 
 
 		 794 aa  701    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  58.53 
 
 		 1137 aa  743    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.72 
 
 		 887 aa  651    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  54.36 
 
 		 739 aa  639    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  52.04 
 
 		 1017 aa  718    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  61.21 
 
 		 847 aa  961    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  51.06 
 
 		 846 aa  792    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  69.52 
 
 		 990 aa  892    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  53.44 
 
 		 1759 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  51.36 
 
 		 985 aa  621  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  50.08 
 
 		 730 aa  595  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  49.56 
 
 		 736 aa  589  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  50.79 
 
 		 725 aa  590  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  48.75 
 
 		 710 aa  562  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  47.38 
 
 		 737 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  46.71 
 
 		 1369 aa  533  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  42.52 
 
 		 742 aa  479  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  42.99 
 
 		 715 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  38.37 
 
 		 707 aa  388  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  34.61 
 
 		 984 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  37.44 
 
 		 686 aa  364  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  34.38 
 
 		 757 aa  345  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  32.64 
 
 		 928 aa  334  5e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  39.92 
 
 		 526 aa  333  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  32.79 
 
 		 961 aa  324  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  37.11 
 
 		 854 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  41.46 
 
 		 563 aa  314  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  31.87 
 
 		 949 aa  313  7.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  32.5 
 
 		 789 aa  304  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  33.51 
 
 		 894 aa  295  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  31.34 
 
 		 778 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 		 611 aa  268  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.33 
 
 		 998 aa  211  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  52.33 
 
 		 727 aa  164  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  29.94 
 
 		 978 aa  158  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  28.68 
 
 		 2042 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  46.54 
 
 		 681 aa  144  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  44.6 
 
 		 543 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  42.06 
 
 		 679 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  42.42 
 
 		 608 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  45.1 
 
 		 743 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  40 
 
 		 1007 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  56.19 
 
 		 775 aa  125  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  43.48 
 
 		 523 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  40.19 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  43.33 
 
 		 978 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  42.23 
 
 		 938 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  56.6 
 
 		 785 aa  122  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  39.07 
 
 		 699 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  42.4 
 
 		 429 aa  120  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  53.4 
 
 		 393 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  56.44 
 
 		 767 aa  117  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.86 
 
 		 979 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  50.94 
 
 		 623 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  50.94 
 
 		 842 aa  114  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  40.82 
 
 		 460 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  48.54 
 
 		 489 aa  111  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  42.25 
 
 		 543 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  50.47 
 
 		 690 aa  109  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  50 
 
 		 580 aa  109  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.57 
 
 		 984 aa  109  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  42.86 
 
 		 875 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  51 
 
 		 966 aa  109  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.47 
 
 		 646 aa  109  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  50.47 
 
 		 854 aa  108  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  50 
 
 		 423 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  51.49 
 
 		 963 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  49.07 
 
 		 934 aa  107  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  49.04 
 
 		 376 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  56.44 
 
 		 589 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  50.5 
 
 		 611 aa  106  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  38.29 
 
 		 1121 aa  105  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  36.02 
 
 		 637 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  39.13 
 
 		 900 aa  105  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  37.56 
 
 		 655 aa  104  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  43.59 
 
 		 973 aa  104  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  53.47 
 
 		 620 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.43 
 
 		 491 aa  102  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  52.08 
 
 		 598 aa  102  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  49.04 
 
 		 597 aa  101  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  47.06 
 
 		 778 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  39.82 
 
 		 719 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  47.66 
 
 		 925 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  44.03 
 
 		 605 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  47.17 
 
 		 913 aa  98.6  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 688 aa  98.2  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.31 
 
 		 436 aa  98.2  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  42.57 
 
 		 488 aa  97.8  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  45.1 
 
 		 669 aa  97.8  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  45.63 
 
 		 432 aa  97.4  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.51 
 
 		 469 aa  97.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  49.04 
 
 		 479 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  47.52 
 
 		 743 aa  96.3  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  46.08 
 
 		 974 aa  96.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  47 
 
 		 596 aa  95.9  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  40 
 
 		 491 aa  95.9  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  42.31 
 
 		 442 aa  95.9  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  42.16 
 
 		 518 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  46.53 
 
 		 681 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>