148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0231 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  73.42 
 
 
742 aa  1131    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 
715 aa  1479    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  44.98 
 
 
730 aa  595  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  45.4 
 
 
725 aa  561  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.74 
 
 
887 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  41.93 
 
 
739 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  42.15 
 
 
736 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  45.97 
 
 
1759 aa  533  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  44.78 
 
 
1369 aa  522  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  43.69 
 
 
846 aa  518  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.41 
 
 
985 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  40.74 
 
 
737 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  39.46 
 
 
710 aa  487  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  42.24 
 
 
794 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  44.37 
 
 
880 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  43.81 
 
 
847 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  41.72 
 
 
990 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  41.93 
 
 
1137 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 
707 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  36.31 
 
 
1017 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  36.49 
 
 
686 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  32.61 
 
 
757 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  36.88 
 
 
526 aa  327  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  31.41 
 
 
949 aa  323  7e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  32.25 
 
 
961 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  38.44 
 
 
563 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 
789 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  32.54 
 
 
984 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  32.16 
 
 
928 aa  303  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  31.59 
 
 
854 aa  286  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  30.12 
 
 
778 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  32.52 
 
 
611 aa  259  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 
894 aa  253  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  28.68 
 
 
590 aa  162  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  28.71 
 
 
978 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  27.88 
 
 
2042 aa  130  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  26.82 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 
649 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  43.02 
 
 
534 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 
1601 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  52.17 
 
 
477 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.18 
 
 
867 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  24.35 
 
 
571 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  24.42 
 
 
537 aa  68.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  45.12 
 
 
885 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  57.89 
 
 
584 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  45.9 
 
 
566 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  48.05 
 
 
873 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  44.71 
 
 
539 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  55.36 
 
 
460 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  24.68 
 
 
906 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  25.28 
 
 
874 aa  64.7  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  23.56 
 
 
646 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.64 
 
 
927 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  45.9 
 
 
477 aa  62  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  20.52 
 
 
621 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  20.94 
 
 
1076 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  24.46 
 
 
587 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  47.54 
 
 
780 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  24.79 
 
 
864 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  50.85 
 
 
722 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  46.3 
 
 
552 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  52.54 
 
 
295 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 
590 aa  58.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  49.25 
 
 
308 aa  58.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  52.38 
 
 
482 aa  57.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  46.55 
 
 
435 aa  57.4  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  39.53 
 
 
1224 aa  57.4  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  48.28 
 
 
955 aa  57.4  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.32 
 
 
582 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  54.55 
 
 
536 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  50 
 
 
807 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  44.07 
 
 
554 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  44.83 
 
 
316 aa  57.4  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  45.45 
 
 
475 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  28.4 
 
 
558 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  52.46 
 
 
833 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  45.16 
 
 
577 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  39.78 
 
 
951 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  40.24 
 
 
583 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  27.01 
 
 
746 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  40.32 
 
 
423 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  24.81 
 
 
623 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  42.65 
 
 
298 aa  54.7  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  45.76 
 
 
563 aa  54.3  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  20.87 
 
 
854 aa  54.3  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  39.44 
 
 
630 aa  54.3  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  40.3 
 
 
773 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
604 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  39.68 
 
 
895 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.33 
 
 
537 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  42.19 
 
 
922 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  43.86 
 
 
621 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.62 
 
 
528 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  42.62 
 
 
415 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
639 aa  52  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  25.86 
 
 
541 aa  52  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  37.66 
 
 
303 aa  51.6  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  42.62 
 
 
580 aa  51.6  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  42.65 
 
 
948 aa  51.6  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>