145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0938 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  100 
 
 		 1969 aa  3859    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1976 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  33.09 
 
 		 2262 aa  215  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 		 3793 aa  212  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.54 
 
 		 1607 aa  197  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1329 aa  174  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  28.23 
 
 		 4120 aa  164  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.51 
 
 		 1507 aa  159  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.53 
 
 		 2713 aa  145  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  31.19 
 
 		 1243 aa  141  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  38.2 
 
 		 1108 aa  139  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  25.71 
 
 		 4429 aa  139  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  27.85 
 
 		 2411 aa  133  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  27.85 
 
 		 2367 aa  132  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  29.6 
 
 		 940 aa  114  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  28.76 
 
 		 1657 aa  113  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  30.03 
 
 		 1079 aa  112  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  27.81 
 
 		 2421 aa  106  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  33.04 
 
 		 1288 aa  106  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.05 
 
 		 1292 aa  105  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  26.96 
 
 		 2454 aa  105  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  37.55 
 
 		 14944 aa  101  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  28.3 
 
 		 938 aa  100  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  34.38 
 
 		 3563 aa  99.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  27.06 
 
 		 430 aa  97.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  27.65 
 
 		 472 aa  95.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.64 
 
 		 2270 aa  93.6  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  26.01 
 
 		 2807 aa  93.2  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  26.58 
 
 		 1750 aa  87.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  27.36 
 
 		 696 aa  87.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  27.94 
 
 		 994 aa  84.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  25.95 
 
 		 2024 aa  84  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  27.55 
 
 		 953 aa  84  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  42.59 
 
 		 972 aa  79.7  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1980 aa  79.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  24.79 
 
 		 1771 aa  78.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.27 
 
 		 1130 aa  77.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  29.92 
 
 		 1266 aa  76.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  25.19 
 
 		 979 aa  76.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28 
 
 		 991 aa  76.3  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  49.46 
 
 		 1550 aa  75.9  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  26.3 
 
 		 2416 aa  75.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  40.91 
 
 		 1132 aa  74.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  41.01 
 
 		 2207 aa  74.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  29.95 
 
 		 532 aa  73.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  24.2 
 
 		 501 aa  73.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.47 
 
 		 714 aa  72  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  26.27 
 
 		 688 aa  69.3  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  27.92 
 
 		 456 aa  68.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  27.27 
 
 		 904 aa  68.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.01 
 
 		 1383 aa  68.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1100 aa  66.6  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  30.32 
 
 		 910 aa  67  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  26.41 
 
 		 1848 aa  66.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  24.24 
 
 		 1345 aa  65.9  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  38.33 
 
 		 815 aa  65.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1059 aa  65.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.11 
 
 		 1362 aa  64.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  44.16 
 
 		 441 aa  63.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  28.15 
 
 		 4978 aa  63.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0420  hypothetical protein  29.27 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  28.78 
 
 		 1247 aa  62  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  28.21 
 
 		 1170 aa  62  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  25.49 
 
 		 480 aa  61.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  23.37 
 
 		 1527 aa  61.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.19 
 
 		 887 aa  62  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.93 
 
 		 826 aa  62  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  25.21 
 
 		 5453 aa  61.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  28.57 
 
 		 822 aa  60.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  23.86 
 
 		 2772 aa  59.3  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 		 775 aa  59.3  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1287 aa  58.9  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  37.23 
 
 		 1295 aa  58.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  31.82 
 
 		 2003 aa  57.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  25.48 
 
 		 553 aa  57.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.71 
 
 		 1221 aa  57  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0645  gp16  41.03 
 
 		 246 aa  57  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  24.36 
 
 		 1987 aa  56.6  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  26.58 
 
 		 436 aa  55.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  39.45 
 
 		 1668 aa  55.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  37.82 
 
 		 1176 aa  55.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  25.99 
 
 		 2418 aa  54.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  30.22 
 
 		 1160 aa  54.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  25 
 
 		 471 aa  54.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.9 
 
 		 1272 aa  54.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  23.81 
 
 		 794 aa  54.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  39.36 
 
 		 1195 aa  54.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  25.94 
 
 		 799 aa  53.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  22.13 
 
 		 925 aa  53.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  31.89 
 
 		 2042 aa  53.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  36.36 
 
 		 1216 aa  53.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  28.77 
 
 		 1127 aa  53.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  31.05 
 
 		 1100 aa  53.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0991  hypothetical protein  26.79 
 
 		 760 aa  52  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.021624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.63 
 
 		 1343 aa  52  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0581  Htaa domain protein  30.83 
 
 		 1098 aa  51.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.892764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  26.38 
 
 		 432 aa  52.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  31.67 
 
 		 1002 aa  51.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  26.46 
 
 		 917 aa  51.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  24.57 
 
 		 463 aa  51.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>