82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2226 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 
591 aa  1229    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  35.85 
 
 
537 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.14 
 
 
582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  37.07 
 
 
571 aa  327  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  35.82 
 
 
578 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  35.54 
 
 
649 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  36.17 
 
 
854 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  33.81 
 
 
587 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  32.15 
 
 
646 aa  273  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  33.39 
 
 
1601 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.51 
 
 
867 aa  246  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.86 
 
 
927 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  31.25 
 
 
885 aa  243  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  32.32 
 
 
833 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  29.67 
 
 
895 aa  237  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.41 
 
 
998 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  29.75 
 
 
1224 aa  233  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  32.13 
 
 
875 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 
812 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  31.8 
 
 
775 aa  225  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  30.72 
 
 
874 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  30.94 
 
 
1100 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  31.96 
 
 
851 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.91 
 
 
611 aa  217  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  30.52 
 
 
864 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.24 
 
 
762 aa  216  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.98 
 
 
786 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.17 
 
 
900 aa  203  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  29.27 
 
 
1105 aa  194  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  30.18 
 
 
739 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  29.69 
 
 
665 aa  161  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 
606 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  26.49 
 
 
803 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 
632 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  25 
 
 
1076 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  24.67 
 
 
621 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  33.78 
 
 
906 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  35.05 
 
 
815 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 
742 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 
611 aa  92  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.7 
 
 
887 aa  90.5  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  24.73 
 
 
2042 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  23.44 
 
 
978 aa  81.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  23.34 
 
 
526 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  25.53 
 
 
880 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 
736 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 
563 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  25.97 
 
 
778 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  27.04 
 
 
715 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 
789 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  21.69 
 
 
707 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  23.26 
 
 
739 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  23.41 
 
 
757 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  26.13 
 
 
570 aa  67.8  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 
730 aa  67  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  22.87 
 
 
949 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  24.36 
 
 
847 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.02 
 
 
985 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 
928 aa  63.9  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  24.15 
 
 
990 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  21.9 
 
 
961 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  25.36 
 
 
1759 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  23.88 
 
 
846 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  30.6 
 
 
613 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  22.27 
 
 
710 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  23.76 
 
 
984 aa  61.2  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  23.44 
 
 
725 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  21 
 
 
737 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  22.62 
 
 
794 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  24.45 
 
 
854 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2743  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 
863 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0843  glycoside hydrolase family 9  28.31 
 
 
559 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0076  glycoside hydrolase family 9  21.73 
 
 
837 aa  54.3  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  22.16 
 
 
686 aa  53.9  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 
1137 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0426  glycoside hydrolase family protein  25.72 
 
 
613 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  26.69 
 
 
1452 aa  47.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4776  glycosy hydrolase family protein  22.1 
 
 
606 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.520076  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03428  hypothetical protein  25.75 
 
 
579 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  21.13 
 
 
1369 aa  45.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  25.32 
 
 
623 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  22.37 
 
 
894 aa  44.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>