193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1155 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  100 
 
 		 1288 aa  2552    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  40.16 
 
 		 942 aa  463  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  40.26 
 
 		 842 aa  439  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  51.66 
 
 		 1108 aa  425  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  54.48 
 
 		 1266 aa  423  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  36.12 
 
 		 978 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  37.84 
 
 		 911 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  37.67 
 
 		 1298 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  47.56 
 
 		 991 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  36.85 
 
 		 935 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  35.5 
 
 		 1904 aa  403  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  37.05 
 
 		 925 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  38.33 
 
 		 913 aa  390  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.43 
 
 		 707 aa  386  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  34.96 
 
 		 906 aa  365  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  45.96 
 
 		 1657 aa  338  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  33.47 
 
 		 934 aa  337  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  33.33 
 
 		 873 aa  334  8e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01542  oligo-xyloglucan specific cellobiohydrolase (Eurofung)  30.92 
 
 		 810 aa  300  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05061  xyloglucanase (Eurofung)  34.41 
 
 		 836 aa  290  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.341133  hitchhiker  0.000000000000191913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4813  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.58 
 
 		 778 aa  240  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  40.91 
 
 		 815 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  36.55 
 
 		 2713 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  33.5 
 
 		 3793 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1329 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  33.56 
 
 		 1748 aa  162  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  37.94 
 
 		 1414 aa  161  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  39.81 
 
 		 1585 aa  160  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  39.81 
 
 		 1217 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  39.42 
 
 		 1474 aa  157  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  44.98 
 
 		 1247 aa  153  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  37.04 
 
 		 2270 aa  152  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1547 aa  152  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  38.19 
 
 		 1160 aa  142  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  36.72 
 
 		 1002 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  36.62 
 
 		 1275 aa  124  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  29.63 
 
 		 5453 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.29 
 
 		 1507 aa  108  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  42.6 
 
 		 1295 aa  106  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  25.54 
 
 		 794 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  32.59 
 
 		 1969 aa  102  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  34.46 
 
 		 808 aa  98.2  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.32 
 
 		 1607 aa  97.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  27.06 
 
 		 1750 aa  92.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  33.26 
 
 		 2402 aa  88.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  27.43 
 
 		 792 aa  87  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  26.46 
 
 		 822 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  27.39 
 
 		 799 aa  87  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  29.7 
 
 		 4429 aa  85.1  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  34.64 
 
 		 904 aa  85.1  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1059 aa  84.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.04 
 
 		 1068 aa  82.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  31.04 
 
 		 910 aa  79.7  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1243 aa  79  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.1 
 
 		 752 aa  78.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  30.16 
 
 		 1094 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  32.1 
 
 		 4978 aa  77.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  26.34 
 
 		 815 aa  76.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  27.53 
 
 		 989 aa  75.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  27.7 
 
 		 1345 aa  75.5  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  25.38 
 
 		 925 aa  74.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  28.92 
 
 		 2487 aa  73.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1100 aa  73.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.86 
 
 		 4071 aa  73.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1386 aa  72.4  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1313 aa  71.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  27.27 
 
 		 3324 aa  70.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  30.63 
 
 		 1452 aa  69.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1287 aa  68.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  26.63 
 
 		 859 aa  67.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  32.24 
 
 		 2367 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  32.24 
 
 		 2411 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  29.55 
 
 		 675 aa  66.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.7 
 
 		 1343 aa  67  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1980 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  26.84 
 
 		 483 aa  67  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  27.62 
 
 		 2278 aa  65.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  24.87 
 
 		 1222 aa  65.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  35.66 
 
 		 2262 aa  65.1  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1303 aa  64.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  28.46 
 
 		 627 aa  64.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  30.81 
 
 		 1079 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.86 
 
 		 735 aa  63.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  30.15 
 
 		 679 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  32.68 
 
 		 14944 aa  63.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  33.49 
 
 		 1488 aa  62.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  26.13 
 
 		 2833 aa  62.4  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  27.13 
 
 		 2807 aa  62  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1976 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  26.56 
 
 		 978 aa  61.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  25 
 
 		 681 aa  60.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  26.18 
 
 		 1620 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  31.91 
 
 		 4120 aa  59.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28.08 
 
 		 3682 aa  58.9  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1111 aa  59.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  27.21 
 
 		 910 aa  58.9  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  30.63 
 
 		 669 aa  58.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  28.29 
 
 		 953 aa  58.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  24.87 
 
 		 3197 aa  57.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  26.73 
 
 		 749 aa  58.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>