61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4258 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 		 621 aa  1293    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  65.44 
 
 		 1076 aa  822    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  63.67 
 
 		 815 aa  759    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  63.44 
 
 		 906 aa  735    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 1601 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  24.67 
 
 		 591 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  25.04 
 
 		 570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.63 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  25.24 
 
 		 646 aa  107  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  24.84 
 
 		 623 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  26.42 
 
 		 833 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  24.33 
 
 		 587 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  24.38 
 
 		 571 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  24.76 
 
 		 653 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  23.47 
 
 		 578 aa  92  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  24.13 
 
 		 885 aa  91.3  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.93 
 
 		 900 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  23.87 
 
 		 649 aa  90.9  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  26.59 
 
 		 739 aa  90.1  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  25.99 
 
 		 1100 aa  89  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  24.71 
 
 		 864 aa  87  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  28.47 
 
 		 665 aa  87  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  22.96 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  25.23 
 
 		 874 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.23 
 
 		 786 aa  80.1  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  24.54 
 
 		 1105 aa  80.1  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.12 
 
 		 998 aa  76.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  23.54 
 
 		 1224 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  23.68 
 
 		 2042 aa  75.5  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 812 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  23.26 
 
 		 895 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.24 
 
 		 867 aa  74.7  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  24.62 
 
 		 851 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.28 
 
 		 927 aa  71.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  21.99 
 
 		 854 aa  71.2  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  24.84 
 
 		 978 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  24.06 
 
 		 775 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  23.1 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  23.26 
 
 		 707 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  22.43 
 
 		 742 aa  64.3  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  25.2 
 
 		 1452 aa  63.9  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 		 606 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.35 
 
 		 887 aa  61.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  21.14 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  23.09 
 
 		 846 aa  57.4  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 		 730 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.31 
 
 		 762 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  20.52 
 
 		 715 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  25.23 
 
 		 875 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  24.78 
 
 		 794 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  21.83 
 
 		 686 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  20.4 
 
 		 526 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26 
 
 		 611 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  22.32 
 
 		 880 aa  47.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  21.38 
 
 		 736 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03428  hypothetical protein  21.44 
 
 		 579 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0144  endoglucanase-related protein  24.23 
 
 		 574 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  21.22 
 
 		 847 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  22.59 
 
 		 739 aa  44.3  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0525  glycoside hydrolase family 9  27.59 
 
 		 609 aa  43.9  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>