160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2621 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  100 
 
 
833 aa  1720    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  51.78 
 
 
1601 aa  800    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  32.32 
 
 
591 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  28.89 
 
 
646 aa  217  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 
649 aa  213  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  28.74 
 
 
885 aa  213  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  28.84 
 
 
874 aa  210  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  29.75 
 
 
578 aa  194  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 
895 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  28.48 
 
 
1100 aa  188  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.39 
 
 
582 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.44 
 
 
900 aa  180  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.59 
 
 
762 aa  180  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  27.83 
 
 
571 aa  177  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  29.74 
 
 
854 aa  171  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.15 
 
 
998 aa  171  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  27.16 
 
 
864 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.96 
 
 
867 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 
632 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 
1224 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.39 
 
 
786 aa  164  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  27.88 
 
 
587 aa  164  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  27.32 
 
 
1105 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 
812 aa  157  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  27.43 
 
 
851 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  26.86 
 
 
775 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.19 
 
 
927 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  24.42 
 
 
537 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  31.99 
 
 
739 aa  140  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 
606 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  27.62 
 
 
875 aa  134  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  24.31 
 
 
803 aa  129  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  26.19 
 
 
665 aa  127  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.71 
 
 
611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  25.34 
 
 
1076 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  26.59 
 
 
621 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  24.9 
 
 
906 aa  108  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  26.25 
 
 
978 aa  91.3  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  23.02 
 
 
611 aa  87.8  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  26 
 
 
2042 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  31.14 
 
 
815 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  25.16 
 
 
526 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  54.1 
 
 
778 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  49.15 
 
 
298 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4776  glycosy hydrolase family protein  26.05 
 
 
606 aa  65.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.520076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 
742 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  23.21 
 
 
563 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0736  cellulosome protein dockerin type I  50 
 
 
424 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00031925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0426  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 
613 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.76 
 
 
807 aa  62.4  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  40.43 
 
 
391 aa  61.6  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.21 
 
 
469 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  46.91 
 
 
532 aa  60.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  55.17 
 
 
722 aa  60.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  27.32 
 
 
570 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  53.12 
 
 
686 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03428  hypothetical protein  22.63 
 
 
579 aa  60.1  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  39.13 
 
 
511 aa  58.9  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  32.06 
 
 
653 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  46.77 
 
 
780 aa  58.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  47.46 
 
 
679 aa  58.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  48.44 
 
 
477 aa  58.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  44.64 
 
 
789 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  46.67 
 
 
949 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  22.38 
 
 
928 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  51.72 
 
 
873 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  44.44 
 
 
567 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  43.33 
 
 
554 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  53.57 
 
 
460 aa  57  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  40.3 
 
 
773 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  43.55 
 
 
837 aa  56.2  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  42.86 
 
 
928 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  51.72 
 
 
584 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  52.46 
 
 
715 aa  56.2  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  44.59 
 
 
757 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  49.15 
 
 
552 aa  55.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  43.1 
 
 
1077 aa  55.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 
746 aa  54.7  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  47.76 
 
 
951 aa  54.7  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.15 
 
 
842 aa  54.3  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  49.23 
 
 
737 aa  54.3  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.09 
 
 
533 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  22.1 
 
 
1452 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  44.26 
 
 
710 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  46.77 
 
 
295 aa  53.5  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  46.43 
 
 
982 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  48.33 
 
 
536 aa  53.5  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  40.98 
 
 
683 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  41.94 
 
 
630 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  43.48 
 
 
308 aa  53.5  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  43.55 
 
 
560 aa  53.5  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  49.15 
 
 
577 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  50.79 
 
 
1122 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  49.15 
 
 
955 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.18 
 
 
710 aa  52.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  42.62 
 
 
948 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  44.64 
 
 
501 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  22.43 
 
 
854 aa  52.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  45.16 
 
 
814 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  38.81 
 
 
965 aa  52  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>