138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2392 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  43.91 
 
 		 895 aa  723    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  45.57 
 
 		 1224 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 		 874 aa  1812    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  77.45 
 
 		 885 aa  1417    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  49.35 
 
 		 812 aa  538  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.53 
 
 		 927 aa  500  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  44.93 
 
 		 775 aa  469  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.52 
 
 		 867 aa  438  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  35.96 
 
 		 1100 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.98 
 
 		 998 aa  429  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.67 
 
 		 762 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  39.54 
 
 		 875 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  39.64 
 
 		 851 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  36.52 
 
 		 864 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.13 
 
 		 786 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  33.82 
 
 		 1105 aa  369  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.41 
 
 		 611 aa  327  8.000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  31.25 
 
 		 646 aa  258  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.39 
 
 		 582 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  33.72 
 
 		 854 aa  246  9e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  31.71 
 
 		 587 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  33.05 
 
 		 578 aa  238  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  32.07 
 
 		 571 aa  233  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 		 649 aa  232  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  30.72 
 
 		 591 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  28.84 
 
 		 833 aa  205  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  25.55 
 
 		 537 aa  166  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 1601 aa  154  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.35 
 
 		 900 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  27.39 
 
 		 526 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  27.2 
 
 		 739 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 		 632 aa  99.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  29.68 
 
 		 803 aa  95.5  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  28.36 
 
 		 665 aa  94  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  25.39 
 
 		 611 aa  93.2  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  25.72 
 
 		 906 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  25 
 
 		 978 aa  81.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  25.23 
 
 		 621 aa  81.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 		 710 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  23.41 
 
 		 1076 aa  77.8  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 		 742 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  28.36 
 
 		 815 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  24.37 
 
 		 563 aa  76.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 		 606 aa  72.4  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  23.39 
 
 		 984 aa  72  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  25.59 
 
 		 2042 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  25.86 
 
 		 686 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.89 
 
 		 887 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  46.99 
 
 		 873 aa  65.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  24.05 
 
 		 880 aa  65.1  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  60 
 
 		 552 aa  63.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  24.95 
 
 		 778 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  50.85 
 
 		 757 aa  60.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  52.46 
 
 		 949 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 961 aa  60.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  47.54 
 
 		 541 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  50.82 
 
 		 536 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  29.47 
 
 		 653 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  23.96 
 
 		 990 aa  59.3  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  52.54 
 
 		 584 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  54.55 
 
 		 722 aa  58.9  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  47.62 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  51.67 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  48.39 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  25.28 
 
 		 715 aa  58.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  28.64 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  22.37 
 
 		 707 aa  57.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  46.43 
 
 		 577 aa  57.4  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  42.19 
 
 		 683 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  53.45 
 
 		 460 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  50.88 
 
 		 725 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  49.12 
 
 		 955 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  50.85 
 
 		 780 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  48.33 
 
 		 746 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  48.33 
 
 		 1122 aa  55.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  54.39 
 
 		 482 aa  55.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 739 aa  55.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  22.22 
 
 		 737 aa  54.7  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  51.79 
 
 		 475 aa  54.7  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  43.55 
 
 		 509 aa  54.7  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  47.54 
 
 		 532 aa  54.3  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  38.89 
 
 		 524 aa  54.3  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  23.57 
 
 		 789 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  42.86 
 
 		 928 aa  54.3  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  45.61 
 
 		 534 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  46.55 
 
 		 295 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  44.26 
 
 		 490 aa  54.3  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 604 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.61 
 
 		 985 aa  53.5  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  24.26 
 
 		 794 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  45.16 
 
 		 732 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  25 
 
 		 847 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  41.33 
 
 		 583 aa  52.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  44.07 
 
 		 965 aa  52.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  44.83 
 
 		 560 aa  52.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 		 1015 aa  52.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  24.49 
 
 		 570 aa  51.6  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  40.28 
 
 		 311 aa  51.2  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  44.26 
 
 		 425 aa  51.2  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  43.86 
 
 		 533 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>