98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0040 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  60.19 
 
 		 739 aa  764    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  68.16 
 
 		 1759 aa  852    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  54.29 
 
 		 1369 aa  824    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  60.48 
 
 		 736 aa  779    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 		 887 aa  1837    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  62.02 
 
 		 725 aa  763    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  65.53 
 
 		 730 aa  802    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  46.4 
 
 		 846 aa  648    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.1 
 
 		 985 aa  843    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  53.82 
 
 		 880 aa  634  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  52.81 
 
 		 710 aa  633  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  51.07 
 
 		 847 aa  621  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  51.82 
 
 		 794 aa  610  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  49.37 
 
 		 990 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  48.48 
 
 		 742 aa  558  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  47.74 
 
 		 715 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  44.77 
 
 		 1017 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  42.97 
 
 		 737 aa  475  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  34.82 
 
 		 928 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  34.05 
 
 		 949 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  33.6 
 
 		 961 aa  429  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  39.94 
 
 		 707 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  38.78 
 
 		 686 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  34.46 
 
 		 984 aa  360  5e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  44.07 
 
 		 563 aa  356  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  42.57 
 
 		 526 aa  356  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  35.1 
 
 		 757 aa  353  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  35.47 
 
 		 789 aa  340  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  33.71 
 
 		 854 aa  325  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  32.9 
 
 		 894 aa  317  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  33.77 
 
 		 778 aa  303  9e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  38.49 
 
 		 611 aa  302  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.32 
 
 		 938 aa  208  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  32.45 
 
 		 590 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  61.38 
 
 		 919 aa  189  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  55.92 
 
 		 857 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  30.86 
 
 		 2042 aa  171  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  29.9 
 
 		 978 aa  160  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  48.68 
 
 		 308 aa  156  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  33.6 
 
 		 1853 aa  155  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  42.7 
 
 		 522 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  36.43 
 
 		 1478 aa  144  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  38.43 
 
 		 1414 aa  144  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  35.31 
 
 		 1294 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  48.34 
 
 		 1904 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.68 
 
 		 833 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  43.67 
 
 		 1546 aa  132  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  44 
 
 		 2344 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  36.06 
 
 		 671 aa  128  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  37.66 
 
 		 505 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  41.89 
 
 		 467 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  37.01 
 
 		 505 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  37.75 
 
 		 678 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  37.75 
 
 		 656 aa  115  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  37.25 
 
 		 763 aa  114  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  36.6 
 
 		 1209 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 1121 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  37.75 
 
 		 1298 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 		 1224 aa  112  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  36.6 
 
 		 1137 aa  112  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  41.91 
 
 		 473 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  36.6 
 
 		 619 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  41.1 
 
 		 728 aa  103  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  37.25 
 
 		 1050 aa  101  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  40.88 
 
 		 486 aa  98.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  35.4 
 
 		 1013 aa  96.3  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  32.52 
 
 		 660 aa  93.2  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  35.29 
 
 		 658 aa  92  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  25.7 
 
 		 591 aa  90.5  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  26.09 
 
 		 571 aa  88.6  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.39 
 
 		 867 aa  81.3  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  26.51 
 
 		 587 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  24.47 
 
 		 646 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  25.49 
 
 		 854 aa  71.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  24.28 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  22.25 
 
 		 885 aa  68.2  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 895 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  24.32 
 
 		 1100 aa  67  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.18 
 
 		 582 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  24.89 
 
 		 874 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 649 aa  65.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 1601 aa  64.7  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  23.6 
 
 		 1076 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  22.35 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  21.96 
 
 		 998 aa  59.3  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  23.45 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  24 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  26.96 
 
 		 570 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.92 
 
 		 927 aa  54.7  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  23.35 
 
 		 906 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.1 
 
 		 786 aa  52.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  23.78 
 
 		 875 aa  52  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  21.81 
 
 		 815 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.3 
 
 		 762 aa  51.2  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  21.77 
 
 		 864 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  22.38 
 
 		 851 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2423  hypothetical protein  32.24 
 
 		 998 aa  47.8  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  22.39 
 
 		 775 aa  47.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>