158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0274 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 563 aa  1161    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  55.62 
 
 		 526 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  45.22 
 
 		 707 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  49.01 
 
 		 686 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  37.8 
 
 		 611 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.54 
 
 		 887 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  40.65 
 
 		 730 aa  350  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.59 
 
 		 985 aa  347  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  40.5 
 
 		 739 aa  343  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  42.29 
 
 		 725 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  40 
 
 		 1759 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  40.46 
 
 		 736 aa  324  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  39.64 
 
 		 1017 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  39.54 
 
 		 710 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  38.98 
 
 		 742 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  37.16 
 
 		 757 aa  320  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  37.79 
 
 		 1369 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  36.79 
 
 		 961 aa  316  6e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  35.95 
 
 		 949 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  39.29 
 
 		 880 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  36.5 
 
 		 778 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  35.65 
 
 		 928 aa  310  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  36.5 
 
 		 984 aa  310  5e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  38.16 
 
 		 846 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 		 789 aa  302  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  39.14 
 
 		 990 aa  301  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  39.37 
 
 		 847 aa  299  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  37.04 
 
 		 715 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  36.33 
 
 		 1137 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  36.72 
 
 		 794 aa  283  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  33.52 
 
 		 854 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  32.16 
 
 		 737 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 		 894 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  29.27 
 
 		 590 aa  167  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  30.94 
 
 		 2042 aa  160  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  29.42 
 
 		 978 aa  159  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 649 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  24.82 
 
 		 895 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  24.42 
 
 		 646 aa  90.5  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  28.57 
 
 		 885 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.48 
 
 		 842 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  44.25 
 
 		 922 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  48.24 
 
 		 591 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.33 
 
 		 831 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.67 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  57.14 
 
 		 982 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  23.88 
 
 		 623 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  44.21 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  23.19 
 
 		 537 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  24.55 
 
 		 874 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  36.94 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  24.08 
 
 		 591 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  44.32 
 
 		 707 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  53.52 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  52.17 
 
 		 477 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  52.11 
 
 		 814 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  53.52 
 
 		 630 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.56 
 
 		 998 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  47.22 
 
 		 590 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  45.63 
 
 		 600 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  56.25 
 
 		 773 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  47.56 
 
 		 619 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.48 
 
 		 790 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  48.35 
 
 		 554 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.38 
 
 		 867 aa  72  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  45.24 
 
 		 1077 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  38.64 
 
 		 900 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  22.88 
 
 		 571 aa  71.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  48.57 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  27.83 
 
 		 854 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  43.88 
 
 		 334 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  46.48 
 
 		 639 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.3 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  47.89 
 
 		 660 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  47.14 
 
 		 679 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.39 
 
 		 511 aa  67  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  48.65 
 
 		 820 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  45.07 
 
 		 1224 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.89 
 
 		 710 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  49.25 
 
 		 948 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.57 
 
 		 582 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.41 
 
 		 611 aa  66.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  40.7 
 
 		 1051 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  37.5 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  49.32 
 
 		 599 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  52.11 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  42.86 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  50.72 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  46.15 
 
 		 571 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  23.12 
 
 		 864 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  42.5 
 
 		 566 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  44.29 
 
 		 501 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  44.29 
 
 		 928 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  44 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  47.14 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  22.86 
 
 		 1601 aa  60.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  50.72 
 
 		 580 aa  61.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.93 
 
 		 807 aa  60.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  21.17 
 
 		 621 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  32.95 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>