272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8280 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  51.14 
 
 		 875 aa  715    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  63.7 
 
 		 998 aa  900    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  100 
 
 		 851 aa  1732    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  52.11 
 
 		 1100 aa  701    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  52.3 
 
 		 1105 aa  665    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  73.44 
 
 		 762 aa  1047    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.08 
 
 		 786 aa  703    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  61.61 
 
 		 864 aa  981    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.07 
 
 		 927 aa  612  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  41.36 
 
 		 895 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  54.09 
 
 		 775 aa  531  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  50.7 
 
 		 812 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  41.44 
 
 		 1224 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  40.08 
 
 		 885 aa  489  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.15 
 
 		 867 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  37.59 
 
 		 874 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.9 
 
 		 611 aa  351  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  33.77 
 
 		 578 aa  270  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  31.96 
 
 		 591 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.5 
 
 		 582 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  30.74 
 
 		 854 aa  229  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  30.52 
 
 		 646 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  29.79 
 
 		 571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 649 aa  214  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  29.27 
 
 		 587 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  29.7 
 
 		 537 aa  187  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  29.15 
 
 		 1601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  27.09 
 
 		 833 aa  177  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.84 
 
 		 900 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  27.77 
 
 		 632 aa  105  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  52.94 
 
 		 393 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  48.15 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  26.34 
 
 		 739 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 688 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  44.12 
 
 		 518 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  25.07 
 
 		 1076 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  26.19 
 
 		 978 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  48.6 
 
 		 543 aa  99.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  43.69 
 
 		 486 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  49.02 
 
 		 488 aa  98.2  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  49.02 
 
 		 489 aa  97.8  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  43.69 
 
 		 773 aa  97.4  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  43.81 
 
 		 436 aa  97.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  47.06 
 
 		 623 aa  96.3  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  50 
 
 		 376 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  41.6 
 
 		 438 aa  95.9  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  45.28 
 
 		 794 aa  95.1  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  25.04 
 
 		 803 aa  95.1  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 774 aa  95.1  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  47.06 
 
 		 842 aa  94.4  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 743 aa  93.2  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  43.14 
 
 		 628 aa  92.8  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  51.09 
 
 		 1209 aa  92.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  44.64 
 
 		 744 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  40.74 
 
 		 609 aa  92.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  46.6 
 
 		 429 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  47.06 
 
 		 681 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 		 606 aa  91.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  51.09 
 
 		 763 aa  90.9  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  44.66 
 
 		 1128 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  42.31 
 
 		 925 aa  90.9  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  44.76 
 
 		 894 aa  90.5  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  42.31 
 
 		 934 aa  90.5  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  40.2 
 
 		 778 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  44.23 
 
 		 746 aa  89.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  25.55 
 
 		 621 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  43.14 
 
 		 605 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.99 
 
 		 681 aa  87.8  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  45.63 
 
 		 767 aa  87.4  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  44.34 
 
 		 913 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  45.19 
 
 		 990 aa  86.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.25 
 
 		 984 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  34.93 
 
 		 1007 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  43.69 
 
 		 611 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  25.74 
 
 		 2042 aa  85.9  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  43.69 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  42.16 
 
 		 1055 aa  85.5  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  44.76 
 
 		 727 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 1137 aa  85.5  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.38 
 
 		 479 aa  84.7  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  41.28 
 
 		 854 aa  84.7  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.16 
 
 		 588 aa  84.3  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  42.45 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  43.88 
 
 		 485 aa  84  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  51.25 
 
 		 1298 aa  83.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  41.75 
 
 		 842 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  43.27 
 
 		 669 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  40.38 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.18 
 
 		 590 aa  82.4  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  43.14 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  45.26 
 
 		 938 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.27 
 
 		 979 aa  82  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  43.69 
 
 		 589 aa  82  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  40.24 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  38.18 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  43.48 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  40.2 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  46.67 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  42.16 
 
 		 596 aa  80.9  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  35.45 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>