63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2725 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 
611 aa  1239    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.91 
 
 
927 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  41.14 
 
 
812 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  41.26 
 
 
775 aa  388  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  39.32 
 
 
1100 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 
895 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 
1224 aa  368  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  35.02 
 
 
885 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.14 
 
 
998 aa  369  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  40.73 
 
 
875 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.89 
 
 
867 aa  363  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  39.38 
 
 
864 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  34.57 
 
 
874 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.41 
 
 
762 aa  349  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  39.9 
 
 
851 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  37.46 
 
 
1105 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.81 
 
 
786 aa  316  7e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  30.36 
 
 
571 aa  239  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  29.76 
 
 
591 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.15 
 
 
582 aa  226  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  29.95 
 
 
854 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  31.87 
 
 
587 aa  217  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  31.97 
 
 
578 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  28.5 
 
 
649 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  27.5 
 
 
646 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  30.34 
 
 
537 aa  170  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  24.66 
 
 
833 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 
1601 aa  123  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.4 
 
 
900 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  25.94 
 
 
803 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  27.43 
 
 
665 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 
563 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 
611 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 
742 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 
632 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  23.65 
 
 
739 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  23.27 
 
 
707 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  24.84 
 
 
2042 aa  68.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  25.77 
 
 
778 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 
789 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  23.12 
 
 
1076 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  24.66 
 
 
978 aa  61.6  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  24.46 
 
 
880 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 
961 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  27.41 
 
 
757 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  24.29 
 
 
715 aa  57.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  22.88 
 
 
949 aa  57.4  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  25.44 
 
 
794 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  26.07 
 
 
621 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  23.97 
 
 
906 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 
928 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  27.5 
 
 
653 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.01 
 
 
887 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  24.58 
 
 
686 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  23.83 
 
 
815 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  22.46 
 
 
737 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  21.54 
 
 
526 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  25.66 
 
 
847 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  24.42 
 
 
606 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  22.26 
 
 
570 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 
730 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  24.92 
 
 
990 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 
710 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>