159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0732 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 895 aa  762    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  47.57 
 
 		 1224 aa  720    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  77.45 
 
 		 874 aa  1417    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 		 885 aa  1836    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  49.51 
 
 		 812 aa  566  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.01 
 
 		 927 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  47.28 
 
 		 775 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.9 
 
 		 867 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  38.87 
 
 		 1100 aa  462  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.67 
 
 		 998 aa  459  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  41.18 
 
 		 875 aa  455  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.86 
 
 		 762 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  40.08 
 
 		 851 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  38 
 
 		 864 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.24 
 
 		 786 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  34.12 
 
 		 1105 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.87 
 
 		 611 aa  335  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.8 
 
 		 582 aa  295  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  31.39 
 
 		 646 aa  283  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  33.06 
 
 		 587 aa  268  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  34.89 
 
 		 578 aa  265  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 649 aa  253  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  32.5 
 
 		 854 aa  252  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  31.6 
 
 		 571 aa  248  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  31.25 
 
 		 591 aa  243  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  28.74 
 
 		 833 aa  207  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  27.68 
 
 		 537 aa  191  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 		 1601 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  28.34 
 
 		 739 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.98 
 
 		 900 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  27.71 
 
 		 526 aa  126  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 632 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 611 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  25.36 
 
 		 803 aa  98.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  24.26 
 
 		 1076 aa  98.6  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  25.68 
 
 		 665 aa  92  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  24.13 
 
 		 621 aa  91.3  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  23.77 
 
 		 815 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  23.55 
 
 		 978 aa  82.4  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  23.32 
 
 		 906 aa  82  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 606 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  24.8 
 
 		 2042 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  64.41 
 
 		 460 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  60.56 
 
 		 725 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  25.06 
 
 		 686 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 		 736 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  54.41 
 
 		 873 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  24.22 
 
 		 880 aa  68.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  61.67 
 
 		 722 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  23.55 
 
 		 984 aa  69.3  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  45.12 
 
 		 715 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  50.72 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  58.82 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.25 
 
 		 887 aa  68.2  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  25.27 
 
 		 778 aa  68.2  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 961 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 739 aa  67  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  25.38 
 
 		 990 aa  66.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  22.95 
 
 		 707 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  32.5 
 
 		 539 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  38.2 
 
 		 391 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  49.25 
 
 		 949 aa  65.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  45.59 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  49.32 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 		 742 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  54.1 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  24.03 
 
 		 794 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  45.35 
 
 		 737 aa  62.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  49.3 
 
 		 534 aa  62.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  53.33 
 
 		 536 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  24.76 
 
 		 789 aa  62.4  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  42.86 
 
 		 436 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  44.74 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  38.98 
 
 		 757 aa  60.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  47.76 
 
 		 295 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  46.88 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  46.15 
 
 		 780 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  51.67 
 
 		 1122 aa  58.9  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  22.71 
 
 		 928 aa  58.9  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.57 
 
 		 985 aa  58.9  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  23.76 
 
 		 847 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  55.74 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  53.33 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  50.91 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  46.67 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 1077 aa  58.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.94 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  41.1 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  50 
 
 		 965 aa  57.8  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  41.79 
 
 		 303 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  40.85 
 
 		 316 aa  57.4  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  23.52 
 
 		 846 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  49.15 
 
 		 955 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  28.37 
 
 		 653 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  45 
 
 		 567 aa  57  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  49.21 
 
 		 732 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  45.16 
 
 		 462 aa  57  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  45 
 
 		 746 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>