151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0730 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  100 
 
 		 460 aa  943    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  53.46 
 
 		 477 aa  488  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  39.74 
 
 		 1152 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  37.47 
 
 		 465 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  31.81 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  32.96 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  34.57 
 
 		 609 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  32.62 
 
 		 1223 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  29.4 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  29.14 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  29.14 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  29.14 
 
 		 453 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  29.71 
 
 		 453 aa  146  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  29.23 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  29.79 
 
 		 543 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  28.95 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  32.94 
 
 		 2690 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  30.61 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 		 412 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  26.96 
 
 		 1748 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 		 430 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  27.15 
 
 		 571 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  24.47 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 		 381 aa  97.8  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 		 912 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 		 1129 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  21.6 
 
 		 376 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 1140 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 		 1140 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 		 1140 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  28.12 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  27.09 
 
 		 691 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  23.21 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  30.13 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  27.23 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  27.66 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  64.41 
 
 		 885 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  32.07 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  56.25 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  28.14 
 
 		 292 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  57.38 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  25.1 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  28.64 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  55.36 
 
 		 715 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  43.9 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2710  chitosanase  30.25 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0388381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  28.33 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  56.9 
 
 		 737 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  59.32 
 
 		 526 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  60 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  52.63 
 
 		 686 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  24.16 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  21.92 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  50 
 
 		 722 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  25.13 
 
 		 348 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  20.39 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  58.06 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  50 
 
 		 873 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  25 
 
 		 2807 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  25.76 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  26.26 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  26.03 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  26.12 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  20.52 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  22.69 
 
 		 362 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  53.57 
 
 		 833 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  20.11 
 
 		 429 aa  57  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  47.76 
 
 		 757 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  43.08 
 
 		 583 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  53.45 
 
 		 874 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  28.69 
 
 		 356 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  28.02 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  29.44 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  22.82 
 
 		 468 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  52.63 
 
 		 528 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  42.67 
 
 		 577 aa  53.5  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  23.97 
 
 		 2772 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  46.48 
 
 		 541 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  34.04 
 
 		 741 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  27.31 
 
 		 371 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  27.31 
 
 		 371 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  27.85 
 
 		 612 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.95 
 
 		 537 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  50.85 
 
 		 536 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  40 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  51.79 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  52.73 
 
 		 539 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  50.94 
 
 		 533 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  49.15 
 
 		 676 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  23.38 
 
 		 367 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  44.44 
 
 		 778 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  27.43 
 
 		 356 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  47.46 
 
 		 435 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  26.24 
 
 		 423 aa  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2687  xylanase Y  27.18 
 
 		 106 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  25.47 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  48.28 
 
 		 982 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>