233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1236 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 		 955 aa  1962    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  35.33 
 
 		 641 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  34.48 
 
 		 614 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  37.38 
 
 		 771 aa  363  9e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  33.46 
 
 		 846 aa  360  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  36.35 
 
 		 803 aa  359  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  34.15 
 
 		 760 aa  357  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  33.88 
 
 		 783 aa  348  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  31.51 
 
 		 795 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  33.39 
 
 		 844 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  31.67 
 
 		 795 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  31.35 
 
 		 795 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  32.62 
 
 		 765 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  33.63 
 
 		 792 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  30.22 
 
 		 597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  27.87 
 
 		 1025 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  32.2 
 
 		 744 aa  272  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  29.14 
 
 		 752 aa  271  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  28.71 
 
 		 749 aa  267  8e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  28.83 
 
 		 881 aa  220  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  26.16 
 
 		 607 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  23.83 
 
 		 602 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  31.16 
 
 		 736 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  26.85 
 
 		 711 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  23.05 
 
 		 596 aa  122  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  37.74 
 
 		 639 aa  104  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  23.77 
 
 		 655 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  25.41 
 
 		 666 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  23.75 
 
 		 636 aa  99  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  28.16 
 
 		 651 aa  99  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  27.8 
 
 		 651 aa  98.6  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  27.8 
 
 		 651 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  27.08 
 
 		 651 aa  97.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  22.5 
 
 		 634 aa  97.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  27.8 
 
 		 651 aa  97.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  28.16 
 
 		 656 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  27.8 
 
 		 656 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 		 659 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  28.16 
 
 		 667 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  22.04 
 
 		 800 aa  93.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  23.46 
 
 		 640 aa  92.4  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  24.45 
 
 		 673 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  35.27 
 
 		 912 aa  90.1  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  39.29 
 
 		 1018 aa  90.1  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  22.85 
 
 		 638 aa  89.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  23.33 
 
 		 684 aa  87.8  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  25.47 
 
 		 648 aa  87.8  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  58.82 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  21.93 
 
 		 652 aa  85.5  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  25.43 
 
 		 652 aa  85.1  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  22.96 
 
 		 647 aa  84.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  22.69 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  35.53 
 
 		 1037 aa  82.8  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  21.93 
 
 		 620 aa  82.8  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  27.39 
 
 		 677 aa  82.4  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  24.11 
 
 		 679 aa  82.4  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  25.69 
 
 		 643 aa  82.4  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  25.48 
 
 		 665 aa  82  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1702  Carbohydrate-binding CenC domain protein  36.67 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  21.5 
 
 		 686 aa  81.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  19.75 
 
 		 647 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  34.04 
 
 		 1019 aa  80.9  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  23.88 
 
 		 672 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  23.24 
 
 		 680 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  34.09 
 
 		 1059 aa  79.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  34.09 
 
 		 1059 aa  79.3  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  23.48 
 
 		 634 aa  78.2  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  23.09 
 
 		 640 aa  77.4  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  24.01 
 
 		 654 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  50 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  24.84 
 
 		 963 aa  76.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  23.1 
 
 		 656 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  56.52 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  22.73 
 
 		 667 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  53.03 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  22.5 
 
 		 684 aa  72.8  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  20.88 
 
 		 659 aa  72.8  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  22.45 
 
 		 640 aa  72.4  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  23.81 
 
 		 678 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  52.31 
 
 		 725 aa  72  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  41.11 
 
 		 311 aa  72  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  24.44 
 
 		 648 aa  71.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  22.66 
 
 		 640 aa  71.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  44.21 
 
 		 949 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  35.71 
 
 		 613 aa  71.2  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  55.22 
 
 		 532 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  45.71 
 
 		 780 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  19.82 
 
 		 648 aa  70.1  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  41.46 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  45.59 
 
 		 541 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  46.15 
 
 		 295 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  47.14 
 
 		 536 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  48.44 
 
 		 746 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  47.83 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  21.68 
 
 		 675 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  34.91 
 
 		 450 aa  67.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  39.51 
 
 		 1187 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  32.09 
 
 		 861 aa  67  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 		 619 aa  67  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  54.69 
 
 		 308 aa  67  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>