19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3094 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  100 
 
 		 450 aa  922    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6207  hypothetical protein  39.48 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  57.95 
 
 		 465 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  54.65 
 
 		 726 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  55.13 
 
 		 692 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  32.84 
 
 		 613 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  35.33 
 
 		 483 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  43.81 
 
 		 957 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  40 
 
 		 1187 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  44.58 
 
 		 884 aa  77  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  39.08 
 
 		 1141 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  45.78 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  46.91 
 
 		 615 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  34.91 
 
 		 955 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  45.24 
 
 		 664 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  44.29 
 
 		 1292 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0346  hypothetical protein  35.16 
 
 		 569 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0788  hypothetical protein  35.42 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2114  hypothetical protein  35.29 
 
 		 549 aa  43.9  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.204968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>