18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2188 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  100 
 
 		 692 aa  1405    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  50.35 
 
 		 957 aa  538  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  41.91 
 
 		 995 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  40.69 
 
 		 483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  31.17 
 
 		 852 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  38.65 
 
 		 613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  51.26 
 
 		 726 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  50 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  33.17 
 
 		 484 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  49.41 
 
 		 1187 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  48.86 
 
 		 884 aa  84.3  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  46.84 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  53.45 
 
 		 1141 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  43.69 
 
 		 615 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1292 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  32.35 
 
 		 955 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  37.63 
 
 		 664 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.09 
 
 		 915 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>