89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1625 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  100 
 
 		 664 aa  1347    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  35.42 
 
 		 1139 aa  77.8  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  35.56 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 737 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  29.24 
 
 		 613 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0423  hypothetical protein  25.88 
 
 		 806 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0374953  normal  0.0190212 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  30.66 
 
 		 510 aa  73.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1288  beta and gamma crystallin  25.88 
 
 		 806 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.17 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.8 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  29.93 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  32.85 
 
 		 691 aa  71.6  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  31.16 
 
 		 1413 aa  70.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1181  hypothetical protein  25.4 
 
 		 806 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.488758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  34.81 
 
 		 491 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.85 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  33.8 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0616  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.57 
 
 		 20646 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  45.24 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  30.95 
 
 		 1259 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  32.03 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  31.82 
 
 		 1187 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  29.2 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  34.33 
 
 		 571 aa  63.9  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.65 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  31.85 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.63 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  32.43 
 
 		 663 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.82 
 
 		 474 aa  63.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  34.31 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  31.17 
 
 		 425 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.09 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  39.56 
 
 		 726 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  29.1 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  26.9 
 
 		 230 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  32.64 
 
 		 2073 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  30.47 
 
 		 897 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.97 
 
 		 695 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  31.94 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.99 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  37.8 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  33.11 
 
 		 576 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.03 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  33.91 
 
 		 569 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2114  hypothetical protein  29.01 
 
 		 549 aa  57  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.204968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  28.17 
 
 		 563 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  30 
 
 		 1141 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  37.63 
 
 		 692 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3468  acetyltransferase domain-containing protein  26.82 
 
 		 815 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000772776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  32.63 
 
 		 955 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  30.2 
 
 		 1033 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  37.35 
 
 		 484 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  29.55 
 
 		 943 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0799  acetyltransferase domain-containing protein  26.74 
 
 		 815 aa  54.7  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000102  normal  0.0229569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  28.68 
 
 		 963 aa  54.3  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3596  GCN5-related N-acetyltransferase  25.99 
 
 		 818 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.25 
 
 		 472 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  30.28 
 
 		 560 aa  53.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  36.27 
 
 		 672 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  28.24 
 
 		 615 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  27.14 
 
 		 445 aa  52.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  26.75 
 
 		 465 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  30.77 
 
 		 771 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  28.67 
 
 		 430 aa  52  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  33.67 
 
 		 483 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  33.71 
 
 		 647 aa  50.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  33 
 
 		 957 aa  50.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  32.5 
 
 		 973 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.31 
 
 		 756 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  32 
 
 		 884 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  34 
 
 		 392 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  31.2 
 
 		 240 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2560  Ricin B lectin  27.13 
 
 		 656 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  29.81 
 
 		 474 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  30.68 
 
 		 497 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  30 
 
 		 239 aa  48.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  28.68 
 
 		 487 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  31.4 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3906  Ricin B lectin  28.15 
 
 		 744 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0306743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0346  hypothetical protein  34.12 
 
 		 569 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1352  hypothetical protein  32.18 
 
 		 180 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  29.84 
 
 		 1100 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  32.8 
 
 		 618 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  26.95 
 
 		 789 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  32.91 
 
 		 1172 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  28.3 
 
 		 824 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  30.3 
 
 		 840 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  32.98 
 
 		 260 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  34.85 
 
 		 1292 aa  43.9  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>