16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0616 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0614  parallel beta-helix repeat-containing protein  64.69 
 
 		 36805 aa  8875    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0616  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 20646 aa  40050    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2196  hemolysin-type calcium-binding region  35.22 
 
 		 15245 aa  599  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  28 
 
 		 15831 aa  292  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  30.87 
 
 		 14829 aa  259  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  22.62 
 
 		 12741 aa  121  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  23.25 
 
 		 8980 aa  97.1  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1154  surface protein  25.19 
 
 		 4713 aa  69.7  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  30.16 
 
 		 2679 aa  68.9  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0574  Hemagluttinin repeat-containing protein  34.34 
 
 		 7238 aa  68.9  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3762  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.08 
 
 		 5342 aa  64.3  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0652  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1373 aa  60.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0788279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 664 aa  60.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  30.19 
 
 		 2737 aa  54.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.83 
 
 		 3132 aa  52.4  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4160  VCBS  32.82 
 
 		 6581 aa  52  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.530259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>