172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2196 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2196  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
15245 aa  29890    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0616  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.8 
 
 
20646 aa  588  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0614  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.42 
 
 
36805 aa  432  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  30.75 
 
 
14829 aa  219  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  27.45 
 
 
15831 aa  211  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.51 
 
 
14916 aa  157  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  24.62 
 
 
12741 aa  99  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  22.82 
 
 
8980 aa  76.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.04 
 
 
2678 aa  66.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  39.13 
 
 
3026 aa  64.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.18 
 
 
588 aa  64.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.48 
 
 
3427 aa  64.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  40.54 
 
 
556 aa  62.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.93 
 
 
2667 aa  62  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.2 
 
 
2885 aa  61.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 
686 aa  61.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  33.9 
 
 
1055 aa  61.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  31.74 
 
 
3209 aa  60.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  37.64 
 
 
1895 aa  60.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  37.3 
 
 
517 aa  60.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  34.03 
 
 
639 aa  60.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  40 
 
 
813 aa  60.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  33.83 
 
 
4798 aa  59.7  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  36.91 
 
 
219 aa  59.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.29 
 
 
1236 aa  58.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.48 
 
 
421 aa  58.9  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  41.67 
 
 
4687 aa  58.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  39.78 
 
 
425 aa  58.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  35.34 
 
 
709 aa  58.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  32.67 
 
 
1631 aa  58.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 
3954 aa  57.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  47.25 
 
 
2954 aa  57.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  46.81 
 
 
3619 aa  57  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  40.7 
 
 
727 aa  56.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  47.22 
 
 
4334 aa  56.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  34.64 
 
 
260 aa  57  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.81 
 
 
3619 aa  57  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  41.84 
 
 
1145 aa  56.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
273 aa  56.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  36.44 
 
 
475 aa  56.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  35.65 
 
 
3587 aa  56.2  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  31.08 
 
 
485 aa  56.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  32.87 
 
 
724 aa  56.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  50 
 
 
5218 aa  55.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  35.25 
 
 
1480 aa  55.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  31.52 
 
 
1164 aa  55.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  36.18 
 
 
652 aa  55.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  36.94 
 
 
475 aa  55.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1154  surface protein  24.93 
 
 
4713 aa  55.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  35.88 
 
 
1424 aa  55.5  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  30.99 
 
 
767 aa  55.5  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
221 aa  55.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.08 
 
 
1052 aa  55.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50 
 
 
5962 aa  54.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  34.71 
 
 
1019 aa  54.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  32.12 
 
 
2336 aa  55.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  32.77 
 
 
572 aa  54.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  34.69 
 
 
491 aa  55.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  44.29 
 
 
1017 aa  54.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  32.7 
 
 
739 aa  54.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  38.71 
 
 
161 aa  54.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0652  hypothetical protein  23.27 
 
 
1373 aa  54.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0788279  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  41.25 
 
 
820 aa  54.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  37.14 
 
 
946 aa  54.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.69 
 
 
1795 aa  54.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  39.53 
 
 
2689 aa  54.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  34.03 
 
 
728 aa  54.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 
709 aa  54.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  44.29 
 
 
1022 aa  54.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.83 
 
 
1963 aa  53.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  35.37 
 
 
424 aa  54.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  36.84 
 
 
1534 aa  54.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  50.88 
 
 
782 aa  53.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  45.31 
 
 
375 aa  53.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.95 
 
 
1279 aa  53.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
243 aa  53.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  34.21 
 
 
396 aa  53.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  31.95 
 
 
1582 aa  53.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  42.35 
 
 
5769 aa  53.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3762  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  24.35 
 
 
5342 aa  53.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.95 
 
 
1372 aa  53.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  47.37 
 
 
781 aa  53.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  41.77 
 
 
7284 aa  52.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  45.83 
 
 
998 aa  52.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  32.99 
 
 
478 aa  52.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  43.48 
 
 
679 aa  52.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  37.96 
 
 
999 aa  52.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  36.3 
 
 
303 aa  52.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  42.86 
 
 
585 aa  52.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  42.86 
 
 
582 aa  52.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  31.58 
 
 
219 aa  52.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  33.06 
 
 
950 aa  52.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  37.36 
 
 
1594 aa  52.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  35.09 
 
 
1175 aa  52.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  33.77 
 
 
1134 aa  52.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  33.87 
 
 
3598 aa  52.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  31.78 
 
 
713 aa  52  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  31.78 
 
 
713 aa  52  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  38.18 
 
 
467 aa  52  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  33.33 
 
 
680 aa  52  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>