More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1979 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  46.53 
 
 		 3619 aa  784    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  48.78 
 
 		 2342 aa  805    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  100 
 
 		 3587 aa  7082    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  45.05 
 
 		 1650 aa  686    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  98.52 
 
 		 3587 aa  6635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  65.04 
 
 		 3094 aa  1285    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  46.33 
 
 		 3608 aa  775    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  52.51 
 
 		 2950 aa  1024    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  48.78 
 
 		 2342 aa  805    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.6 
 
 		 3619 aa  789    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  42.74 
 
 		 1625 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2871  Animal heme peroxidase  41.34 
 
 		 1712 aa  617  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  42.78 
 
 		 2775 aa  111  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  36.43 
 
 		 769 aa  108  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  37.76 
 
 		 1883 aa  104  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.46 
 
 		 2678 aa  103  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.69 
 
 		 3427 aa  99.8  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  29.39 
 
 		 1079 aa  99.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  32.92 
 
 		 820 aa  98.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  32.04 
 
 		 795 aa  99  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 		 946 aa  97.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  45.19 
 
 		 1424 aa  97.8  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.3 
 
 		 1795 aa  97.1  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.44 
 
 		 980 aa  96.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.42 
 
 		 2667 aa  95.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  38.61 
 
 		 1164 aa  95.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  35.04 
 
 		 329 aa  94.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  35.04 
 
 		 329 aa  94.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  27.8 
 
 		 3954 aa  94.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  35.62 
 
 		 2105 aa  92.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  30.68 
 
 		 2133 aa  92.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  34.52 
 
 		 1400 aa  91.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  32.87 
 
 		 734 aa  91.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  40.3 
 
 		 1145 aa  92  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  43.85 
 
 		 2182 aa  92  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  32.3 
 
 		 741 aa  91.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.72 
 
 		 1236 aa  91.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  40.31 
 
 		 232 aa  92  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.33 
 
 		 813 aa  92.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 387 aa  91.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.07 
 
 		 556 aa  91.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.03 
 
 		 1279 aa  90.9  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  27.52 
 
 		 860 aa  90.9  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.76 
 
 		 2245 aa  90.9  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2936  peroxidase  26.65 
 
 		 714 aa  90.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  28.66 
 
 		 4798 aa  90.5  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  30.41 
 
 		 2954 aa  90.1  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  35.74 
 
 		 1534 aa  89.4  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  32.75 
 
 		 1287 aa  89.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  32.81 
 
 		 1156 aa  89  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  49.57 
 
 		 2885 aa  89  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  33.61 
 
 		 491 aa  88.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.32 
 
 		 1363 aa  89  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  28.41 
 
 		 745 aa  88.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  32.75 
 
 		 437 aa  87.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  27.66 
 
 		 2911 aa  87  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.89 
 
 		 1963 aa  86.7  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  42.73 
 
 		 744 aa  86.3  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  31.76 
 
 		 437 aa  86.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 		 4334 aa  86.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  34.24 
 
 		 534 aa  85.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  31.34 
 
 		 648 aa  86.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  34.39 
 
 		 595 aa  85.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  38.28 
 
 		 4800 aa  85.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.57 
 
 		 1499 aa  85.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  32.51 
 
 		 982 aa  85.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  33.33 
 
 		 1480 aa  85.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.97 
 
 		 588 aa  84  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  44.92 
 
 		 460 aa  84  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  39.24 
 
 		 1532 aa  84  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.43 
 
 		 421 aa  83.6  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  35.55 
 
 		 959 aa  83.2  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 2107 aa  83.2  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  30.21 
 
 		 768 aa  82.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  27.55 
 
 		 1112 aa  82.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  36.32 
 
 		 534 aa  82.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  36.04 
 
 		 833 aa  82.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  32.33 
 
 		 1855 aa  81.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  36.36 
 
 		 728 aa  82  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  33.46 
 
 		 2097 aa  81.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  31.82 
 
 		 2701 aa  82  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  38.51 
 
 		 717 aa  81.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  34.94 
 
 		 855 aa  81.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  36.36 
 
 		 615 aa  81.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  33.21 
 
 		 1895 aa  81.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1306 aa  81.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  35.16 
 
 		 257 aa  80.9  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  34.78 
 
 		 243 aa  80.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  34.47 
 
 		 965 aa  80.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  30.38 
 
 		 2198 aa  80.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  46.23 
 
 		 679 aa  81.3  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  42.11 
 
 		 1175 aa  80.5  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  33.94 
 
 		 1055 aa  80.1  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  41.89 
 
 		 686 aa  80.1  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  41.57 
 
 		 327 aa  80.1  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  39.01 
 
 		 938 aa  79.7  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  48.04 
 
 		 582 aa  79.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  41.46 
 
 		 245 aa  79.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.51 
 
 		 1016 aa  79.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.93 
 
 		 1197 aa  79.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>