More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5158 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  81.2 
 
 		 1532 aa  2449    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 1534 aa  3042    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  42.27 
 
 		 946 aa  278  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.37 
 
 		 1279 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.07 
 
 		 3954 aa  266  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  41.46 
 
 		 4334 aa  260  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  37.5 
 
 		 2954 aa  255  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.71 
 
 		 1795 aa  243  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.76 
 
 		 1415 aa  239  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.09 
 
 		 1363 aa  238  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  38.34 
 
 		 1400 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  36.49 
 
 		 2807 aa  232  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  38.24 
 
 		 9867 aa  230  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  32.56 
 
 		 2467 aa  227  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  38.61 
 
 		 595 aa  222  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  37.14 
 
 		 824 aa  221  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  37.39 
 
 		 965 aa  220  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  35.59 
 
 		 2911 aa  218  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  40.64 
 
 		 2105 aa  216  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  32.09 
 
 		 4800 aa  212  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.55 
 
 		 2689 aa  201  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  37.82 
 
 		 2133 aa  197  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.3 
 
 		 3427 aa  197  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.1 
 
 		 2678 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 		 526 aa  197  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  41.24 
 
 		 613 aa  194  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.24 
 
 		 1499 aa  193  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.53 
 
 		 1424 aa  189  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.91 
 
 		 1164 aa  189  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.23 
 
 		 980 aa  185  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  41.78 
 
 		 2198 aa  184  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  41.6 
 
 		 833 aa  183  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  36.91 
 
 		 3026 aa  181  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  43.94 
 
 		 851 aa  180  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  32.77 
 
 		 1764 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3588  hypothetical protein  50.58 
 
 		 187 aa  176  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00728857  normal  0.427342 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  46.13 
 
 		 491 aa  175  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  52.56 
 
 		 999 aa  172  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  52.56 
 
 		 1480 aa  172  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.93 
 
 		 556 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  34.52 
 
 		 1855 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  39.66 
 
 		 341 aa  169  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.06 
 
 		 3619 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  31.17 
 
 		 860 aa  166  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  38.59 
 
 		 3619 aa  166  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  33.78 
 
 		 1156 aa  166  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  34.32 
 
 		 1079 aa  166  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  44.4 
 
 		 907 aa  165  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  36.5 
 
 		 795 aa  164  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  39.61 
 
 		 1287 aa  163  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.12 
 
 		 2667 aa  162  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  43.25 
 
 		 387 aa  160  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  34.54 
 
 		 1134 aa  160  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  36.05 
 
 		 1133 aa  160  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  37.36 
 
 		 3209 aa  158  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  43.04 
 
 		 4687 aa  157  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  37.94 
 
 		 3608 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.86 
 
 		 2775 aa  156  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  50.32 
 
 		 1383 aa  154  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  43.46 
 
 		 363 aa  154  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  34.02 
 
 		 1884 aa  154  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  41.93 
 
 		 1895 aa  154  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  39.88 
 
 		 393 aa  154  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.64 
 
 		 2668 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  40.57 
 
 		 2145 aa  151  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  30.15 
 
 		 1145 aa  150  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  41.72 
 
 		 341 aa  149  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  41.86 
 
 		 387 aa  149  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  31.14 
 
 		 1544 aa  147  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  45.41 
 
 		 460 aa  146  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  37.11 
 
 		 615 aa  146  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  38.89 
 
 		 850 aa  144  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  41.16 
 
 		 437 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  43.02 
 
 		 982 aa  142  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  40.46 
 
 		 396 aa  141  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  41.03 
 
 		 437 aa  141  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  35.85 
 
 		 959 aa  141  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  33.03 
 
 		 14829 aa  141  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  34.41 
 
 		 2950 aa  139  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  32.03 
 
 		 4723 aa  137  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  33.68 
 
 		 589 aa  136  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.56 
 
 		 588 aa  136  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  45.79 
 
 		 1610 aa  136  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  42.95 
 
 		 589 aa  135  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  36.57 
 
 		 1197 aa  135  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  38.05 
 
 		 561 aa  134  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  32.72 
 
 		 15831 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  37.94 
 
 		 1043 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.97 
 
 		 1236 aa  132  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  34.53 
 
 		 745 aa  132  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  39.66 
 
 		 768 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  31.88 
 
 		 1582 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  36.68 
 
 		 820 aa  129  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  51.65 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  48.72 
 
 		 395 aa  129  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  48.72 
 
 		 395 aa  128  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  34.75 
 
 		 855 aa  126  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 5171 aa  126  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  35.01 
 
 		 518 aa  125  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  46.35 
 
 		 1610 aa  125  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>