More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0430 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  58.58 
 
 		 2852 aa  747    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  67.59 
 
 		 2182 aa  1635    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  100 
 
 		 2701 aa  5391    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  57.84 
 
 		 3977 aa  890    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  63.41 
 
 		 1587 aa  621  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  44.78 
 
 		 1355 aa  406  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  48.96 
 
 		 539 aa  363  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  48.76 
 
 		 539 aa  360  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  51.72 
 
 		 945 aa  359  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  44.25 
 
 		 592 aa  329  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  42.67 
 
 		 576 aa  325  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  43.35 
 
 		 546 aa  313  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  40.42 
 
 		 1322 aa  310  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  44.22 
 
 		 533 aa  307  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  44.19 
 
 		 501 aa  303  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  40.12 
 
 		 498 aa  302  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  37.69 
 
 		 633 aa  297  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  40.72 
 
 		 624 aa  296  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  41.24 
 
 		 551 aa  289  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  39.35 
 
 		 600 aa  283  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  41.25 
 
 		 774 aa  283  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  38.92 
 
 		 622 aa  281  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  39.85 
 
 		 624 aa  281  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.16 
 
 		 1795 aa  280  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 629 aa  278  8e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  40.04 
 
 		 857 aa  278  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  39.39 
 
 		 624 aa  276  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  41.96 
 
 		 506 aa  275  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  40.83 
 
 		 635 aa  272  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  34.35 
 
 		 575 aa  271  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  39.02 
 
 		 624 aa  269  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  40.64 
 
 		 567 aa  265  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  39.05 
 
 		 624 aa  265  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  38.83 
 
 		 624 aa  265  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  40.42 
 
 		 600 aa  263  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  38.64 
 
 		 624 aa  262  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  38.49 
 
 		 624 aa  261  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  38.45 
 
 		 624 aa  261  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  40.72 
 
 		 2796 aa  260  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  34.57 
 
 		 598 aa  258  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  36.73 
 
 		 627 aa  247  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  37.07 
 
 		 599 aa  240  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  37.5 
 
 		 621 aa  239  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  37.42 
 
 		 622 aa  238  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  50.74 
 
 		 2198 aa  237  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  50.74 
 
 		 2133 aa  234  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  34.56 
 
 		 589 aa  228  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  32.74 
 
 		 601 aa  224  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  56.86 
 
 		 4231 aa  219  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  33.03 
 
 		 589 aa  217  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  37.56 
 
 		 2954 aa  200  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  46.15 
 
 		 768 aa  195  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  52.04 
 
 		 2853 aa  194  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  52.43 
 
 		 2820 aa  192  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  52.74 
 
 		 1175 aa  191  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  47.01 
 
 		 3598 aa  190  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  41.73 
 
 		 3209 aa  189  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  50.98 
 
 		 2001 aa  189  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  51 
 
 		 11716 aa  188  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  48.29 
 
 		 4465 aa  177  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  43.98 
 
 		 2467 aa  176  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  32.85 
 
 		 1019 aa  148  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  34.14 
 
 		 615 aa  145  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0524  metallophosphoesterase  30.29 
 
 		 721 aa  139  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  43.68 
 
 		 2132 aa  139  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0512  alkaline phosphatase  31.8 
 
 		 521 aa  138  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  41.08 
 
 		 486 aa  137  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  39.55 
 
 		 535 aa  135  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  39.67 
 
 		 727 aa  135  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  34.18 
 
 		 1055 aa  134  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  46.63 
 
 		 2097 aa  130  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  33.88 
 
 		 631 aa  130  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2010  Alkaline phosphatase  31.22 
 
 		 627 aa  130  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.208798  normal  0.40879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3159  Alkaline phosphatase  32.61 
 
 		 571 aa  130  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0625023  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1983  Alkaline phosphatase  31.39 
 
 		 627 aa  130  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  44.33 
 
 		 3954 aa  129  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  37.23 
 
 		 648 aa  129  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 1610 aa  125  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  37.5 
 
 		 1650 aa  125  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  40.3 
 
 		 3544 aa  125  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  39.11 
 
 		 820 aa  124  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  30.58 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  37.17 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  32.36 
 
 		 497 aa  121  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  47.31 
 
 		 4334 aa  120  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  31.8 
 
 		 364 aa  117  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  37.56 
 
 		 3699 aa  117  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  39.5 
 
 		 2522 aa  116  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.3 
 
 		 3699 aa  116  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  43.09 
 
 		 1197 aa  115  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  39.34 
 
 		 2807 aa  115  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  36.75 
 
 		 1883 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  38.25 
 
 		 1133 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  33.85 
 
 		 574 aa  114  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  38.69 
 
 		 395 aa  114  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  27.27 
 
 		 423 aa  113  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  31.25 
 
 		 525 aa  113  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  31.75 
 
 		 503 aa  112  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1019  phosphohydrolase  30.28 
 
 		 410 aa  112  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  39.2 
 
 		 395 aa  112  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>