More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5021 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  100 
 
 
717 aa  1453    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  36.83 
 
 
742 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  36.32 
 
 
728 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  34.53 
 
 
739 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  35.02 
 
 
729 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  35.81 
 
 
736 aa  335  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  34.16 
 
 
724 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  34.19 
 
 
680 aa  297  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  36.11 
 
 
639 aa  292  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  31.48 
 
 
620 aa  266  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  32.67 
 
 
572 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.18 
 
 
1279 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  34.41 
 
 
2954 aa  115  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.88 
 
 
980 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  43.79 
 
 
260 aa  111  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  32.96 
 
 
946 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  31.7 
 
 
1287 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  31.89 
 
 
2667 aa  108  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 
795 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.08 
 
 
1363 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  35.27 
 
 
595 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  32.03 
 
 
9867 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  33.87 
 
 
3619 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
2105 aa  104  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  41.95 
 
 
327 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  33.61 
 
 
5171 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  36.44 
 
 
460 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  32.84 
 
 
1534 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  33.55 
 
 
3619 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.19 
 
 
3427 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  35.15 
 
 
491 aa  100  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  49.18 
 
 
219 aa  99.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 
833 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  38.71 
 
 
813 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.59 
 
 
1795 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  42.68 
 
 
243 aa  97.8  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  36.46 
 
 
361 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  33.33 
 
 
1424 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  36.46 
 
 
361 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  44.8 
 
 
982 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  30.99 
 
 
1895 aa  96.3  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  36.1 
 
 
606 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.1 
 
 
1016 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  46.09 
 
 
615 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  37.57 
 
 
219 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  45.86 
 
 
950 aa  94.7  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  25.99 
 
 
613 aa  94.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.63 
 
 
588 aa  94.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  31.84 
 
 
2775 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  32.93 
 
 
526 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.56 
 
 
1236 aa  94.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.84 
 
 
3954 aa  94  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  34.84 
 
 
361 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.6 
 
 
1963 aa  92.8  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  46.88 
 
 
4334 aa  93.2  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  34.18 
 
 
1532 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.58 
 
 
2689 aa  92  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  35.42 
 
 
387 aa  91.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  45.6 
 
 
257 aa  91.7  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  30.48 
 
 
1164 aa  90.9  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  44.08 
 
 
202 aa  90.9  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  44.08 
 
 
202 aa  90.9  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  43.92 
 
 
232 aa  90.9  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  32.12 
 
 
2145 aa  90.5  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  40.88 
 
 
709 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.41 
 
 
2885 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  37.26 
 
 
734 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  38.21 
 
 
424 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  43.21 
 
 
355 aa  89  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.22 
 
 
2668 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  39.29 
 
 
679 aa  88.2  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  28.15 
 
 
1499 aa  87.8  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  34.73 
 
 
1712 aa  87.8  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  31.82 
 
 
965 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.66 
 
 
280 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.66 
 
 
280 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  33.48 
 
 
741 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  45.22 
 
 
744 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.53 
 
 
1400 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  39.29 
 
 
585 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  29.74 
 
 
998 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  34.53 
 
 
4800 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  31.72 
 
 
4798 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  39.29 
 
 
582 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  41.09 
 
 
1594 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  34.48 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  35.32 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  42.19 
 
 
686 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  31.39 
 
 
824 aa  84.3  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  32.3 
 
 
561 aa  84.3  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  36.72 
 
 
273 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.6 
 
 
2678 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  45.54 
 
 
767 aa  83.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  27.84 
 
 
4687 aa  82.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  35.61 
 
 
341 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  39.84 
 
 
1306 aa  82.4  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  38.2 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  34.64 
 
 
1043 aa  82  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  35.51 
 
 
589 aa  81.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  45.97 
 
 
518 aa  81.6  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>