More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4754 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 3427 aa  6773    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  96.68 
 
 		 337 aa  651    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0338  extracellular solute-binding protein family 3  39.63 
 
 		 389 aa  242  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000810551  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2086  extracellular solute-binding protein family 3  40 
 
 		 363 aa  240  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2062  extracellular solute-binding protein family 3  40 
 
 		 363 aa  240  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0246  extracellular solute-binding protein  41.49 
 
 		 359 aa  237  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0715  extracellular solute-binding protein family 3  40.31 
 
 		 362 aa  236  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.337122 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4667  extracellular solute-binding protein family 3  40.81 
 
 		 364 aa  234  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0740  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 		 356 aa  227  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1998  extracellular solute-binding protein  38.99 
 
 		 343 aa  224  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2522  family 1 extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 		 355 aa  220  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  46.65 
 
 		 946 aa  217  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1168  extracellular solute-binding protein  38.3 
 
 		 349 aa  215  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.42 
 
 		 1795 aa  213  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2557  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.92 
 
 		 343 aa  213  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584097  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0614  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 353 aa  212  8e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11305  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14271  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 353 aa  212  9e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0741  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.23 
 
 		 343 aa  211  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0736  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.23 
 
 		 343 aa  211  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2899  extracellular solute-binding protein family 3  35.85 
 
 		 340 aa  211  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.507436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1454  extracellular solute-binding protein  39.38 
 
 		 389 aa  211  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  48.91 
 
 		 2954 aa  209  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4005  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 		 389 aa  209  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0149  extracellular solute-binding protein  37.54 
 
 		 343 aa  209  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0394116  decreased coverage  0.0000000197566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4393  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 		 341 aa  207  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6377  extracellular solute-binding protein family 3  37.07 
 
 		 337 aa  207  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  43.13 
 
 		 2105 aa  206  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1113  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.27 
 
 		 340 aa  206  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1108  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.4 
 
 		 341 aa  206  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3923  putative amino-acid ABC transporter, substrate-binding protein  35.69 
 
 		 338 aa  206  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2984  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 		 367 aa  205  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47136 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2071  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 		 344 aa  205  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0757625  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1760  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.84 
 
 		 341 aa  204  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1563  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.84 
 
 		 341 aa  204  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2136  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 		 339 aa  204  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204406 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  48.73 
 
 		 1164 aa  203  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4179  extracellular solute-binding protein family 3  36.11 
 
 		 350 aa  202  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1420  extracellular solute-binding protein  38.69 
 
 		 415 aa  202  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217844  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1695  extracellular solute-binding protein  38.69 
 
 		 411 aa  202  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0207768  hitchhiker  0.000479364 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12321  ABC transporter for amino acids, substrate binding protein  36.53 
 
 		 349 aa  202  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0921639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3587  extracellular solute-binding protein  36.11 
 
 		 345 aa  201  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0949603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5870  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.62 
 
 		 340 aa  200  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2549  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.67 
 
 		 350 aa  199  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216585  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.09 
 
 		 1424 aa  199  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2324  extracellular solute-binding protein  35.26 
 
 		 344 aa  199  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.3 
 
 		 1279 aa  198  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2832  extracellular solute-binding protein family 3  34.06 
 
 		 353 aa  199  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  43.3 
 
 		 1534 aa  197  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0233  extracellular solute-binding protein family 3  34.93 
 
 		 341 aa  198  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3988  extracellular solute-binding protein family 3  35.26 
 
 		 350 aa  197  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1747  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.48 
 
 		 338 aa  196  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.913718  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2912  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 337 aa  196  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.392971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3397  hypothetical protein  38.39 
 
 		 345 aa  196  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167886  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12151  ABC transporter for amino acids, substrate binding protein  35 
 
 		 349 aa  196  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0393  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.48 
 
 		 338 aa  196  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0323019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1072  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 		 342 aa  196  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0948  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.67 
 
 		 339 aa  195  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1602  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.83 
 
 		 336 aa  195  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1529  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 		 346 aa  195  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2558  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  33.44 
 
 		 338 aa  195  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1705  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.27 
 
 		 340 aa  195  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.402619 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0890  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.67 
 
 		 339 aa  196  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  53.85 
 
 		 547 aa  195  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3707  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 		 341 aa  194  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.371845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4546  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 		 336 aa  194  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3560  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 342 aa  194  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.801082 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2057  general L-amino acid-binding periplasmic protein precursor  34.58 
 
 		 342 aa  193  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1809  extracellular solute-binding protein  35.94 
 
 		 353 aa  193  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0973  extracellular solute-binding protein  34.78 
 
 		 343 aa  193  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.846042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0229  extracellular solute-binding protein family 3  35.22 
 
 		 341 aa  192  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1297  general amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.02 
 
 		 342 aa  192  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2503  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.48 
 
 		 338 aa  192  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003418  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.96 
 
 		 342 aa  192  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.49248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2551  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  36.62 
 
 		 341 aa  192  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1255  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.02 
 
 		 342 aa  191  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1406  extracellular solute-binding protein  34.37 
 
 		 339 aa  191  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0793  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.98 
 
 		 341 aa  191  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1640  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 		 337 aa  191  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2946  extracellular solute-binding protein family 3  35.09 
 
 		 344 aa  190  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  53.15 
 
 		 1175 aa  190  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0904  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 		 342 aa  190  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.700259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1004  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  33.33 
 
 		 340 aa  189  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3563  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.64 
 
 		 341 aa  188  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3652  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.64 
 
 		 341 aa  189  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3701  extracellular solute-binding protein family 3  34.91 
 
 		 343 aa  188  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  43.23 
 
 		 3954 aa  188  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3462  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.64 
 
 		 341 aa  188  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02361  hypothetical protein  33.64 
 
 		 350 aa  188  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0438  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 341 aa  188  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  46.76 
 
 		 833 aa  189  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0975  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.96 
 
 		 342 aa  187  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0561977  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3754  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.64 
 
 		 341 aa  188  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.248765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4587  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.64 
 
 		 341 aa  188  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0847  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 		 367 aa  187  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4428  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 		 342 aa  187  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4094  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 		 339 aa  187  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0267267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0779  extracellular solute-binding protein  34.37 
 
 		 350 aa  187  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4552  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 		 342 aa  186  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3857  extracellular solute-binding protein family 3  33.96 
 
 		 343 aa  185  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164094  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03126  predicted amino-acid transporter subunit  33.97 
 
 		 305 aa  184  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>